More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2458 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  100 
 
 		 398 aa  806    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  52.09 
 
 		 383 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  50.75 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  52.12 
 
 		 383 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  52.81 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  51.25 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  50.25 
 
 		 385 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  52.16 
 
 		 390 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  51.72 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  48.75 
 
 		 407 aa  328  7e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  46.26 
 
 		 368 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  47.7 
 
 		 389 aa  299  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  42.86 
 
 		 389 aa  296  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  48.12 
 
 		 386 aa  292  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  49.7 
 
 		 379 aa  289  5.0000000000000004e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  41.78 
 
 		 367 aa  280  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  45.89 
 
 		 379 aa  279  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  44.86 
 
 		 394 aa  269  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  40.28 
 
 		 344 aa  266  5e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  44.9 
 
 		 382 aa  266  5e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  44.9 
 
 		 382 aa  266  5e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  43.81 
 
 		 388 aa  265  7e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  45.7 
 
 		 359 aa  265  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  41.77 
 
 		 376 aa  261  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  43.93 
 
 		 361 aa  259  6e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  44.77 
 
 		 382 aa  259  7e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  40.32 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  43.24 
 
 		 413 aa  257  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  40.81 
 
 		 399 aa  256  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  41.69 
 
 		 360 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  43.24 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  45.15 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  41.13 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  40.22 
 
 		 387 aa  249  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  40.23 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  42.09 
 
 		 394 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  38.46 
 
 		 386 aa  246  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  39.94 
 
 		 382 aa  246  6e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  38.76 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  41.07 
 
 		 362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  41.4 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  41.67 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  38.21 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  38.27 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  40.9 
 
 		 394 aa  240  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  39.49 
 
 		 464 aa  239  8e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  36.19 
 
 		 433 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  36.77 
 
 		 355 aa  238  2e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  41.13 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  37.53 
 
 		 389 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  38.56 
 
 		 393 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4683  HflK protein  38.68 
 
 		 393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  39.23 
 
 		 435 aa  236  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  37.47 
 
 		 414 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  36.88 
 
 		 436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  39.69 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  37.99 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  33.04 
 
 		 503 aa  233  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4892  HflK protein  37.89 
 
 		 405 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.42676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4768  HflK protein  37.89 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  34.08 
 
 		 498 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  38.06 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  42.28 
 
 		 399 aa  229  5e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1222  hypothetical protein  38.99 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0015724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  41.28 
 
 		 357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0637  HflK protein  38.19 
 
 		 389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128609 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2767  HflK protein  37.02 
 
 		 394 aa  226  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397323  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  40.5 
 
 		 393 aa  225  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  37.99 
 
 		 477 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  39.2 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  36.55 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1158  HflK protein  37.5 
 
 		 475 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  37.67 
 
 		 474 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  40.32 
 
 		 471 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  40.36 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  39.62 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  39.62 
 
 		 451 aa  220  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  35.09 
 
 		 447 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4944  HflK protein  37.5 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  35.68 
 
 		 465 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  36.21 
 
 		 459 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5671  protease subunit HflK  37.64 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65280  protease subunit HflK  37.53 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  38.01 
 
 		 362 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  39.12 
 
 		 360 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  38.24 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07560  membrane bound protease regulator HflK  39.94 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  36.93 
 
 		 454 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  37 
 
 		 442 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  36.93 
 
 		 454 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  35.54 
 
 		 395 aa  213  7e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  37.53 
 
 		 445 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  40.28 
 
 		 347 aa  212  7.999999999999999e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  37.5 
 
 		 464 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  37 
 
 		 437 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  37 
 
 		 437 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  36.93 
 
 		 449 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  37 
 
 		 437 aa  212  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  35.88 
 
 		 456 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2079  HflK  39.79 
 
 		 457 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>