More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2521 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2521  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 531 aa  1070    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0155875  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0245  radical SAM family protein  40.68 
 
 		 502 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000162793  hitchhiker  0.0000142762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3373  radical SAM domain-containing protein  37.9 
 
 		 503 aa  296  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2989  Radical SAM domain protein  38.17 
 
 		 500 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0213  radical SAM domain-containing protein  42.6 
 
 		 429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25181  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0098  radical SAM domain-containing protein  33 
 
 		 716 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21534  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2450  radical SAM domain-containing protein  29.12 
 
 		 590 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1423  radical SAM/B12 binding domain protein  28.68 
 
 		 715 aa  170  5e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.623089  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2210  radical SAM domain-containing protein  30.63 
 
 		 565 aa  135  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0100  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 		 705 aa  119  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0253265  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0105  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 636 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1855  radical SAM family protein  27.44 
 
 		 638 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.357803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2787  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 732 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.231637  normal  0.0637853 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1420  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 632 aa  108  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2019  Radical SAM domain protein  21.49 
 
 		 525 aa  108  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0788272  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4370  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 634 aa  107  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0112  Fe-S oxidoreductase  26.13 
 
 		 726 aa  107  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3586  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 732 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00751133 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0050  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 707 aa  104  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4972  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 738 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991033  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0070  Radical SAM domain protein  27.18 
 
 		 635 aa  103  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1481  radical SAM family protein  26.43 
 
 		 644 aa  102  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.177835  normal  0.151823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0089  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 643 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2276  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 642 aa  98.6  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3504  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 646 aa  97.8  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0246  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 647 aa  97.1  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1777  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 737 aa  95.1  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.54513 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3570  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 658 aa  94.4  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.370781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1155  radical SAM family protein  25.38 
 
 		 658 aa  93.2  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.74 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  23.15 
 
 		 1250 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3233  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 531 aa  77.4  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 		 518 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1133  radical SAM family protein  25.5 
 
 		 656 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0262562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  23.88 
 
 		 864 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.49 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 564 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4968  Radical SAM domain protein  30.27 
 
 		 652 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1590  Radical SAM domain protein  24.35 
 
 		 488 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  29.05 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 473 aa  66.6  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  23.65 
 
 		 548 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  29.05 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 521 aa  66.6  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0875  radical SAM family Fe-S protein  30.95 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  22.54 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  28.09 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1684  radical SAM family protein  27.88 
 
 		 633 aa  65.1  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.198354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.83 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  29.81 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  28.5 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  26.42 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3390  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.53 
 
 		 485 aa  63.9  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1302  Radical SAM domain protein  23.59 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0143596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  24.53 
 
 		 563 aa  63.5  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 524 aa  63.5  0.000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0512  Radical SAM domain protein  21.73 
 
 		 486 aa  63.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00191  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  31.18 
 
 		 506 aa  63.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  22.78 
 
 		 487 aa  63.2  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  30.43 
 
 		 298 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3764  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.49 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.427217  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0229  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.32 
 
 		 547 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3455  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.49 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207743  normal  0.273738 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.64 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  23.95 
 
 		 507 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6339  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  30.17 
 
 		 479 aa  62  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0973  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  29.05 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.91955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.6 
 
 		 546 aa  61.2  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.908643  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3654  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.93 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176133  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  21.89 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 		 516 aa  60.1  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1063  Fe-S oxidoreductase  25.27 
 
 		 537 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.297828  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  26.99 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2158  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.15 
 
 		 546 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  27.78 
 
 		 609 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3422  Radical SAM domain protein  23.34 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.32 
 
 		 512 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7154  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  29.05 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535479  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2292  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 634 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  24.47 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  23.25 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1863  radical SAM family protein  23.36 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300057  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.37 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4198  radical SAM domain-containing protein  27.82 
 
 		 620 aa  57.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0178344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.37 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  26.27 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>