170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2008 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  100 
 
 		 203 aa  401  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  83.74 
 
 		 203 aa  353  6.999999999999999e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  81.28 
 
 		 203 aa  350  8e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  79.8 
 
 		 203 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1307  proteasome endopeptidase complex  54.21 
 
 		 200 aa  224  1e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.644154  normal  0.454168 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0392  proteasome endopeptidase complex  50.78 
 
 		 204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  51.6 
 
 		 196 aa  206  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2268  proteasome endopeptidase complex  45.74 
 
 		 196 aa  182  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0694  proteasome endopeptidase complex  42.49 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1097  proteasome endopeptidase complex  40.11 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.186534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0052  proteasome endopeptidase complex  39.89 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0529482 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1728  proteasome endopeptidase complex  36.18 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0560482 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  36.65 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0021  proteasome endopeptidase complex  38.25 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1384  proteasome endopeptidase complex  36.32 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.711715 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0778  Proteasome, beta-type subunit, conserved site  37.23 
 
 		 211 aa  135  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24869  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1825  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  34.78 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  36.17 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  36.73 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0194  proteasome subunit beta  33.85 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0055  proteasome endopeptidase complex  34.43 
 
 		 202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.671684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0846  proteasome endopeptidase complex  35.64 
 
 		 209 aa  131  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.982484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0374  proteasome endopeptidase complex  33.15 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000269819  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1198  proteasome endopeptidase complex  35.5 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.156853  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  35.08 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2052  proteasome endopeptidase complex  32.46 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0458  proteasome endopeptidase complex  37.57 
 
 		 206 aa  125  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.180759 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0608  20S proteasome A and B subunits  34.57 
 
 		 243 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.109869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  33.16 
 
 		 219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0123  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  31.61 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  32.14 
 
 		 219 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  32.14 
 
 		 219 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  32.45 
 
 		 219 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2664  Proteasome endopeptidase complex  35.14 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33268  predicted protein  30.29 
 
 		 227 aa  104  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.994073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0514  20S proteasome A and B subunits  34.17 
 
 		 250 aa  101  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20007  predicted protein  29.9 
 
 		 283 aa  97.4  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02080  proteasome component pts1, putative  29.26 
 
 		 301 aa  96.7  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  32.29 
 
 		 249 aa  96.3  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30003  predicted protein  30.57 
 
 		 204 aa  96.3  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.537126  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  30.57 
 
 		 259 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27330  predicted protein  30.43 
 
 		 297 aa  94  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00217957  normal  0.014135 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1568  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  32.95 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51691  proteasome beta subunit  31.61 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  30.05 
 
 		 259 aa  92  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  30.57 
 
 		 259 aa  92  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03756  putative proteasome core beta subunit (Eurofung)  29.02 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.866002 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3351  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  32.2 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36375  predicted protein  28.04 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2272  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  30.68 
 
 		 237 aa  88.6  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  29.53 
 
 		 259 aa  88.2  7e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_65073  20S proteasome, regulatory subunit beta type PSMB7/PSMB10/PUP1  29.35 
 
 		 267 aa  87.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.197238 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  28.65 
 
 		 237 aa  87  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03730  proteasome subunit beta type 3, putative  27.08 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  30.86 
 
 		 240 aa  85.1  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39963  predicted protein  28.93 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02085  proteasome component Pup1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04910)  28.34 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.217986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  30.69 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  29.71 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  28.96 
 
 		 245 aa  81.6  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  27.87 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  28.81 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  30 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62487  predicted protein  25.26 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.838538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  29.48 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  30.29 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  29.02 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38885  predicted protein  25.94 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39514  predicted protein  26.29 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03530  proteasome subunit, beta type, 7, putative  27.18 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  28.8 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03932  proteasome component Pre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08310)  26.63 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04449  proteasome component Pup3, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07420)  24.86 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0018  Proteasome endopeptidase complex  32.18 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.815812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41720  predicted protein  26.18 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.484147  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  30.29 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  26.92 
 
 		 243 aa  77.8  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  25.68 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  32.58 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43808  predicted protein  26.37 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.963237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_5311  predicted protein  26.13 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00710268  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19341  predicted protein  28.65 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03493  conserved hypothetical protein  25.98 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03070  hypothetical protein  27.17 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0444499  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  25.26 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  30.34 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  28.81 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  30.17 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5128  predicted protein  27.89 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.199024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  28.65 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  30 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  26.86 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55763  predicted protein  27.51 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04457  20S proteasome beta-type subunit (Eurofung)  27.75 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0477671  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05784  putative proteasome core component, beta 6 subunit (Eurofung)  25.93 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.109693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  28.57 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  29.21 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  27.12 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_6151  predicted protein  26.6 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276783  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01080  hypothetical protein  22.96 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>