104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_13243 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  100 
 
 		 618 aa  1270    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  49.36 
 
 		 811 aa  577  1.0000000000000001e-163  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  48.87 
 
 		 788 aa  555  1e-156  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  49.17 
 
 		 795 aa  551  1e-156  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  47.63 
 
 		 717 aa  526  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  43.68 
 
 		 693 aa  397  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  41.51 
 
 		 688 aa  382  1e-105  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  39.96 
 
 		 700 aa  369  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  39.09 
 
 		 882 aa  365  1e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  38.56 
 
 		 689 aa  364  2e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  40.79 
 
 		 755 aa  353  4e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  40.19 
 
 		 695 aa  353  4e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  38.38 
 
 		 660 aa  347  3e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  36.27 
 
 		 963 aa  345  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  39.27 
 
 		 841 aa  345  1e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  36.21 
 
 		 949 aa  344  2e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  41.73 
 
 		 679 aa  343  7e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  41.71 
 
 		 680 aa  342  1e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  38.87 
 
 		 796 aa  342  2e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  41.73 
 
 		 682 aa  340  5e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  41.19 
 
 		 680 aa  337  5e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  38.78 
 
 		 696 aa  336  5.999999999999999e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  37.18 
 
 		 700 aa  336  7e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  36.89 
 
 		 700 aa  333  6e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  36.99 
 
 		 989 aa  331  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  37.41 
 
 		 808 aa  331  3e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  37.12 
 
 		 686 aa  329  7e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  36.46 
 
 		 739 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  35.46 
 
 		 717 aa  327  3e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  34.96 
 
 		 706 aa  327  6e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  37.04 
 
 		 694 aa  325  1e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  38.63 
 
 		 707 aa  324  3e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  37.85 
 
 		 724 aa  319  1e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  34.79 
 
 		 703 aa  319  1e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  35.79 
 
 		 729 aa  318  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  37.23 
 
 		 667 aa  317  4e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  35.36 
 
 		 890 aa  317  6e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  37.94 
 
 		 791 aa  314  2.9999999999999996e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  37.98 
 
 		 932 aa  313  6.999999999999999e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  36.53 
 
 		 551 aa  312  1e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  35.89 
 
 		 848 aa  302  1e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  35.11 
 
 		 859 aa  302  1e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  35.37 
 
 		 847 aa  298  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  34.24 
 
 		 915 aa  296  9e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.564524 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  35.88 
 
 		 876 aa  292  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  34.4 
 
 		 686 aa  286  5e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  36.01 
 
 		 709 aa  286  7e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  33.73 
 
 		 761 aa  268  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  32.04 
 
 		 675 aa  246  9e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  33.45 
 
 		 556 aa  244  5e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  37.24 
 
 		 1059 aa  230  6e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  36.47 
 
 		 1064 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  29.35 
 
 		 676 aa  219  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  30.76 
 
 		 670 aa  217  5e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  27.66 
 
 		 676 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  28.5 
 
 		 672 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  27.82 
 
 		 676 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  27.99 
 
 		 672 aa  213  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 1342 aa  207  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  30.46 
 
 		 717 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  40.36 
 
 		 873 aa  198  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  30.89 
 
 		 674 aa  197  6e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  29.77 
 
 		 710 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  31.27 
 
 		 467 aa  194  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  27.71 
 
 		 710 aa  194  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  29.03 
 
 		 674 aa  193  9e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  29.72 
 
 		 710 aa  193  9e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  29.56 
 
 		 710 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  29.03 
 
 		 674 aa  192  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  38.1 
 
 		 458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  28.74 
 
 		 668 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  32.22 
 
 		 487 aa  190  8e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  27.16 
 
 		 674 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  28.4 
 
 		 676 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  25.53 
 
 		 717 aa  183  7e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  27.55 
 
 		 710 aa  171  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  28.01 
 
 		 626 aa  171  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  29.06 
 
 		 677 aa  164  6e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  29.06 
 
 		 677 aa  164  6e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  27.84 
 
 		 724 aa  157  6e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  30.28 
 
 		 607 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 1412 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5038  ATPase involved in replication control Cdc46/Mcm family-like protein  26.77 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3421  Mg chelatase-related protein  25.73 
 
 		 506 aa  47.8  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.11 
 
 		 334 aa  47.4  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  normal  0.0709428 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0276  magnesium chelatase, ChlI subunit  28.67 
 
 		 619 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650073  normal  0.0615582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0418  Mg chelatase, subunit ChlI  24.56 
 
 		 507 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249358  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2132  Mg chelatase-related protein  27.08 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0159677  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2048  Mg chelatase-related protein  27.08 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0235921  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  24.65 
 
 		 507 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_222  Holliday junction DNA helicase  25.31 
 
 		 312 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0156  Mg chelatase, subunit ChlI  28.99 
 
 		 508 aa  45.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2447  Mg chelatase-related protein  23.01 
 
 		 516 aa  44.7  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0332  Mg chelatase, subunit ChlI  24.56 
 
 		 506 aa  44.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  25.29 
 
 		 513 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  24.82 
 
 		 506 aa  44.3  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  25.36 
 
 		 508 aa  44.3  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2359  Mg chelatase, subunit ChlI  26 
 
 		 530 aa  44.3  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2393  Mg chelatase, subunit ChlI  25.36 
 
 		 503 aa  43.9  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  25.86 
 
 		 513 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>