40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40831 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_40831  predicted protein  100 
 
 
374 aa  767    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.353784  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_49988  predicted protein  94.91 
 
 
452 aa  526  1e-148  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0418  pheromone shutdown protein  28.62 
 
 
404 aa  104  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0026  TraB family protein  30.57 
 
 
396 aa  103  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.820387  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1376  TraB family protein  32.53 
 
 
401 aa  99  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2666  TraB family protein  30.62 
 
 
390 aa  96.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1730  TraB family protein  30.31 
 
 
461 aa  96.7  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0979  pheromone shutdown protein  31.5 
 
 
517 aa  93.6  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2520  TraB family protein  28.63 
 
 
390 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.412665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0738  TraB family protein  30.8 
 
 
398 aa  90.1  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.070919  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0317  TraB family protein  28.78 
 
 
402 aa  89.7  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0914094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1076  pheromone shutdown protein PrgY-lke protein  27.65 
 
 
403 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.535689  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0242  TraB family protein  27.38 
 
 
393 aa  87  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.605672  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2685  TraB family protein  31.2 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1446  hypothetical protein  27.94 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2345  TraB family protein  28.52 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.832029  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1751  TraB family protein  27.45 
 
 
392 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.521048 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1394  TraB family protein  26.21 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.420274 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0670  pheromone shutdown protein  27.52 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1396  TraB family protein  26.54 
 
 
380 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2875  TraB family protein  29.03 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.926692  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0014  TraB family protein  26.46 
 
 
399 aa  77  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1280  TraB family protein  25.19 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.999223 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0536  pheromone shutdown protein  25.48 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.91172  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1586  TraB family protein  28.29 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0676  TraB family protein  25.57 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.203898  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0461  TraB family protein  29.25 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0863  TraB determinant protein  27.72 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1545  TraB family protein  28.68 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1639  TraB family protein  29.84 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840587  normal  0.624161 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1288  TraB family protein  24.9 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1546  TraB family protein  28.85 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0436  TraB family protein  27.02 
 
 
499 aa  63.9  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00884  pheromone shutdown protein  28.06 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0178153  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1623  TraB determinant protein  30.13 
 
 
589 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38424  predicted protein  25.28 
 
 
256 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.257444  hitchhiker  0.00184169 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3495  TraB determinant protein  29.75 
 
 
629 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.612629  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2748  TraB family protein  27.16 
 
 
523 aa  54.3  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1603  pheromone shutdown protein  26.27 
 
 
405 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0860  TraB determinant protein  25.47 
 
 
603 aa  48.9  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.484373  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>