226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_16357 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  50 
 
 		 388 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  48.39 
 
 		 479 aa  268  7e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  43.22 
 
 		 1077 aa  225  6e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  46.89 
 
 		 797 aa  221  7e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  43.22 
 
 		 1090 aa  219  3e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  46.04 
 
 		 466 aa  214  9.999999999999999e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  41.28 
 
 		 952 aa  210  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  40.35 
 
 		 655 aa  186  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  39.02 
 
 		 754 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  39.5 
 
 		 1999 aa  179  4e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  43.22 
 
 		 622 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  41.82 
 
 		 619 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  39.78 
 
 		 2245 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  41.45 
 
 		 622 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  39.86 
 
 		 643 aa  171  9e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  39.78 
 
 		 1189 aa  170  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  38.33 
 
 		 650 aa  169  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  38.13 
 
 		 464 aa  168  7e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  37.98 
 
 		 650 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  42.22 
 
 		 651 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  39.64 
 
 		 609 aa  166  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  38.75 
 
 		 553 aa  166  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  38.75 
 
 		 553 aa  166  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  39.01 
 
 		 686 aa  156  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  36.59 
 
 		 633 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  35.16 
 
 		 633 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  33.81 
 
 		 636 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  36.23 
 
 		 633 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  36 
 
 		 633 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  36.73 
 
 		 315 aa  149  5e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  32.85 
 
 		 635 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  33.57 
 
 		 632 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  33.7 
 
 		 611 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  33.93 
 
 		 636 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  34.93 
 
 		 795 aa  143  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  33.66 
 
 		 716 aa  142  5e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  33.01 
 
 		 1048 aa  139  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  31.86 
 
 		 748 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  38.49 
 
 		 752 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  32.39 
 
 		 715 aa  129  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  35.33 
 
 		 941 aa  125  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  31.86 
 
 		 1097 aa  123  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  32.73 
 
 		 629 aa  123  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  35.48 
 
 		 902 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  35.71 
 
 		 986 aa  118  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  30.03 
 
 		 1099 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  33.92 
 
 		 934 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  30.34 
 
 		 1653 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  32.82 
 
 		 606 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  32.87 
 
 		 486 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  34.41 
 
 		 902 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1018 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  30.49 
 
 		 2310 aa  105  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  31.64 
 
 		 1038 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  36.45 
 
 		 237 aa  102  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  34.62 
 
 		 901 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  29.89 
 
 		 585 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  28.99 
 
 		 1620 aa  95.1  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  29.54 
 
 		 297 aa  92.4  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  30.19 
 
 		 1585 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  30.19 
 
 		 1585 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  26.88 
 
 		 1427 aa  90.1  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  28.82 
 
 		 769 aa  89  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  29.66 
 
 		 759 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  31.47 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  29.31 
 
 		 759 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  29.31 
 
 		 759 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  29.31 
 
 		 759 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  28.47 
 
 		 759 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  28.97 
 
 		 759 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  28.47 
 
 		 769 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  28.97 
 
 		 759 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  30.13 
 
 		 1651 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  28.05 
 
 		 521 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  28.82 
 
 		 759 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  28.82 
 
 		 759 aa  84  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  28.7 
 
 		 1108 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  28.1 
 
 		 2013 aa  82  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  28.78 
 
 		 1041 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  28.62 
 
 		 1973 aa  80.9  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  29.02 
 
 		 1422 aa  79.7  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14090  predicted protein  41.38 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1823 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  30.18 
 
 		 1163 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  29.68 
 
 		 1111 aa  76.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2598  putative DNA helicase  27.31 
 
 		 1945 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0444969 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  31.49 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1572  hypothetical protein  29.09 
 
 		 2198 aa  75.1  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3691  DNA helicase-related protein  29.35 
 
 		 2207 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449824 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  28.62 
 
 		 1980 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  28.16 
 
 		 1986 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33296  predicted protein  43.96 
 
 		 634 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  30.5 
 
 		 1153 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  30.68 
 
 		 1082 aa  72.4  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  28.62 
 
 		 2016 aa  72.4  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1118 aa  72  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0240  putative DNA helicase  27.7 
 
 		 1754 aa  71.2  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.610605  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1116 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  28.21 
 
 		 1151 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>