39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_33296 on replicon NC_009362
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009362  OSTLU_33296  predicted protein  100 
 
 
634 aa  1298    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  30.29 
 
 
2245 aa  101  5e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  37.4 
 
 
1999 aa  90.9  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  31.49 
 
 
1077 aa  85.1  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  30.43 
 
 
797 aa  78.2  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  32.95 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  31.25 
 
 
1090 aa  75.1  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  43.96 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  37.4 
 
 
754 aa  66.6  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  34.48 
 
 
655 aa  66.2  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  39.56 
 
 
795 aa  65.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  32.35 
 
 
1189 aa  65.1  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14090  predicted protein  27.62 
 
 
219 aa  64.3  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  29.82 
 
 
609 aa  64.3  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  29.96 
 
 
464 aa  63.9  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  40.74 
 
 
388 aa  62.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  43.06 
 
 
315 aa  62.4  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  29.69 
 
 
466 aa  62  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  29.82 
 
 
622 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  24.77 
 
 
952 aa  58.2  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  22.49 
 
 
553 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  28.77 
 
 
619 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  22.49 
 
 
553 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  29.03 
 
 
622 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  27.6 
 
 
1653 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  28.19 
 
 
651 aa  50.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  30.1 
 
 
633 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  33.04 
 
 
643 aa  48.9  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  41.67 
 
 
650 aa  48.1  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  41.67 
 
 
650 aa  48.1  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  28.44 
 
 
686 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  30.1 
 
 
633 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  23.17 
 
 
632 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  30.1 
 
 
633 aa  46.2  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  32.48 
 
 
748 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  23.62 
 
 
716 aa  45.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  23.36 
 
 
636 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  26.04 
 
 
636 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  22.22 
 
 
635 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>