186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1598 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1598  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
226 aa  454  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.698067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0234  Lipoprotein signal peptidase-like protein  48.68 
 
 
219 aa  188  5.999999999999999e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290036  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02475  putative signal peptidase  50 
 
 
203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248092  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0418  peptidase A8 signal peptidase II  52.17 
 
 
200 aa  180  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.216588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0700  lipoprotein signal peptidase  51.6 
 
 
199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2030  lipoprotein signal peptidase  52.57 
 
 
198 aa  159  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3677  signal peptidase II  40.64 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.273504  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4392  lipoprotein signal peptidase  40.11 
 
 
240 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000433749  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5729  Lipoprotein signal peptidase-like protein  39.55 
 
 
261 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0018  lipoprotein signal peptidase  35.65 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  35.84 
 
 
193 aa  102  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  30 
 
 
169 aa  74.7  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  28.88 
 
 
164 aa  72  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  30.57 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  29.27 
 
 
168 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  28.42 
 
 
182 aa  62  0.000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  28 
 
 
169 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  30.86 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  27.66 
 
 
168 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  29.03 
 
 
195 aa  59.7  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  26.64 
 
 
176 aa  59.3  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  29.27 
 
 
166 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  27.8 
 
 
166 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  27.8 
 
 
166 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  27.8 
 
 
166 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  27.8 
 
 
166 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  27.8 
 
 
166 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  27.8 
 
 
166 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  27.8 
 
 
166 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  30.65 
 
 
171 aa  58.9  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  28.88 
 
 
163 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  29.19 
 
 
171 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  29.79 
 
 
170 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  29.79 
 
 
170 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  29.79 
 
 
170 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  29.19 
 
 
171 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  29.19 
 
 
171 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  29.79 
 
 
170 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  27.57 
 
 
164 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  27.8 
 
 
166 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  28.65 
 
 
171 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  29.13 
 
 
166 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  27.46 
 
 
178 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  29.84 
 
 
164 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  28.29 
 
 
166 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  28.29 
 
 
166 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  28.29 
 
 
166 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  28.64 
 
 
174 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  28.29 
 
 
166 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  28.65 
 
 
173 aa  55.5  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  27.8 
 
 
166 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  30.22 
 
 
170 aa  55.1  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  29.73 
 
 
180 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  27.8 
 
 
166 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  26.61 
 
 
176 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  27.96 
 
 
148 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  27.23 
 
 
163 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  27.84 
 
 
157 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 
170 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  28.18 
 
 
170 aa  52.4  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  25.97 
 
 
163 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  27.03 
 
 
172 aa  52.8  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  27.72 
 
 
170 aa  52.4  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  26.92 
 
 
168 aa  52.4  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1775  lipoprotein signal peptidase  30.43 
 
 
159 aa  52.4  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  28.96 
 
 
144 aa  52.4  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  25.93 
 
 
201 aa  52  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  27.68 
 
 
173 aa  51.6  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  27.03 
 
 
168 aa  51.6  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06350  lipoprotein signal peptidase  27.8 
 
 
173 aa  51.6  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.27868  normal  0.129428 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  28.65 
 
 
172 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  25.91 
 
 
176 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  29.73 
 
 
180 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  25.65 
 
 
174 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  26.18 
 
 
174 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  33.05 
 
 
170 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
162 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  32.71 
 
 
168 aa  49.7  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  28.12 
 
 
172 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  31.13 
 
 
153 aa  50.1  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  23.83 
 
 
159 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  32.35 
 
 
154 aa  49.7  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  26.88 
 
 
163 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  26.88 
 
 
163 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  24.55 
 
 
197 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  31.36 
 
 
191 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  32.35 
 
 
154 aa  49.7  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  24.88 
 
 
160 aa  49.3  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  34.45 
 
 
155 aa  49.3  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  31.78 
 
 
171 aa  49.3  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  29.2 
 
 
210 aa  48.9  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  34.26 
 
 
145 aa  48.9  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  33.65 
 
 
170 aa  48.9  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  33.65 
 
 
170 aa  48.9  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  27.03 
 
 
163 aa  48.5  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  28.45 
 
 
158 aa  48.5  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  27.04 
 
 
145 aa  47.8  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  27.6 
 
 
160 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0013  lipoprotein signal peptidase  25.15 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  22.92 
 
 
159 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>