More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0047 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  59 
 
 
692 aa  645  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2600  ATP-dependent metalloprotease FtsH  70.7 
 
 
641 aa  696  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0232  hypothetical protein  52.72 
 
 
691 aa  650  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1654  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.05 
 
 
652 aa  688  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3001  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.2 
 
 
676 aa  670  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0623369  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  100 
 
 
673 aa  1385  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07931  putative transmembrane AAA-metalloprotease FtsH  56.87 
 
 
691 aa  725  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0466  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.88 
 
 
673 aa  655  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0030  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.16 
 
 
696 aa  681  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.876867  normal  0.384468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.23 
 
 
685 aa  640  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0836  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.24 
 
 
697 aa  608  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1526  ATP-dependent zinc metallopeptidase  49.11 
 
 
628 aa  560  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155575  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.54 
 
 
631 aa  558  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.78 
 
 
628 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.78 
 
 
628 aa  557  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.23 
 
 
697 aa  553  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.849156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0571  cell division protein FtsH  48.06 
 
 
628 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1615  cell division protein FtsH  48.06 
 
 
628 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.24975  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  53 
 
 
631 aa  550  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  3.94436e-08  unclonable  2.72669e-07 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2188  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.44 
 
 
649 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.350229  normal  0.438236 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4439  FtsH peptidase  47.58 
 
 
632 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172586  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.58 
 
 
631 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0816  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.58 
 
 
627 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1512  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.06 
 
 
628 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0580139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2776  cell division protein FtsH  48.06 
 
 
628 aa  551  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182791  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.06 
 
 
628 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0580  cell division protein FtsH  48.06 
 
 
628 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.51431  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2170  peptidase M41, FtsH  48.14 
 
 
627 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.415072  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1288  cell division protein FtsH  48.06 
 
 
628 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.725972  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1297  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.58 
 
 
631 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.17526  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.32 
 
 
629 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0777  cell division protein FtsH  48.06 
 
 
628 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.19 
 
 
621 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0078  peptidase M41, FtsH  48.73 
 
 
706 aa  546  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0143352  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  58.05 
 
 
699 aa  547  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.57 
 
 
631 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1174  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.57 
 
 
631 aa  547  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378107  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1262  FtsH peptidase  47.58 
 
 
629 aa  548  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.46 
 
 
686 aa  546  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1013  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.7 
 
 
621 aa  545  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.99 
 
 
634 aa  544  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.56 
 
 
629 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  46.13 
 
 
641 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  50.9 
 
 
638 aa  540  1e-152  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  52.17 
 
 
639 aa  541  1e-152  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.22 
 
 
640 aa  539  1e-152  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0123  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.74 
 
 
699 aa  542  1e-152  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.72 
 
 
638 aa  539  1e-152  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.17 
 
 
639 aa  541  1e-152  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05140  ATPase, putative  46.3 
 
 
817 aa  540  1e-152  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0164604  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.59 
 
 
640 aa  539  1e-152  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  46.89 
 
 
614 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  46.92 
 
 
608 aa  538  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.86964e-12  hitchhiker  9.19555e-11 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.43 
 
 
642 aa  536  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.75 
 
 
673 aa  533  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  7.47191e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.17 
 
 
621 aa  535  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  3.90574e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.5 
 
 
630 aa  533  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.68 
 
 
639 aa  535  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  45.53 
 
 
640 aa  533  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.9 
 
 
655 aa  529  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  53.93 
 
 
694 aa  528  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  47.24 
 
 
651 aa  527  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  7.21667e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.15 
 
 
637 aa  527  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.8 
 
 
694 aa  527  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.4836  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.62 
 
 
676 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  49.29 
 
 
660 aa  524  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.82706e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  52.5 
 
 
639 aa  523  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  48.11 
 
 
659 aa  524  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.36506e-06  decreased coverage  4.2164e-05 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  50.67 
 
 
641 aa  523  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  8.45189e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.01 
 
 
639 aa  523  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  52.35 
 
 
645 aa  522  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  49.11 
 
 
658 aa  521  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.16 
 
 
645 aa  521  1e-146  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2639  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.71 
 
 
612 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0879  FtsH peptidase  46.88 
 
 
611 aa  521  1e-146  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23646  predicted protein  56.34 
 
 
648 aa  521  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  46.03 
 
 
612 aa  521  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34770  Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein RCA1 (TAT-binding homolog 12)  53.17 
 
 
867 aa  520  1e-146  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00577984  normal  0.0143281 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0592  cell division protein FtsH  48.86 
 
 
660 aa  521  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000468831  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  51.53 
 
 
612 aa  516  1e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  46.35 
 
 
626 aa  518  1e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  45.44 
 
 
636 aa  516  1e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  54.35 
 
 
700 aa  515  1e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.51 
 
 
657 aa  517  1e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.20805e-05  hitchhiker  6.81699e-06 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.17 
 
 
645 aa  518  1e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  48.21 
 
 
616 aa  518  1e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.53226e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.83 
 
 
635 aa  518  1e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.62887e-05  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04557  mitochondrial inner membrane AAA protease Yta12, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02680)  44.83 
 
 
883 aa  518  1e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  51.39 
 
 
644 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.83259e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0811  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.36 
 
 
663 aa  512  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.569146  hitchhiker  0.0043584 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.48 
 
 
650 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  7.74852e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  51.39 
 
 
647 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  4.70783e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  50.37 
 
 
643 aa  512  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  4.99281e-05  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.51 
 
 
615 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  48.08 
 
 
657 aa  512  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.61981e-06  hitchhiker  8.32625e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.16 
 
 
655 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.17945e-06  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3555  ATP-dependent metalloprotease  50.56 
 
 
647 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00594001  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6194  FtsH-2 peptidase  45.27 
 
 
646 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  46.28 
 
 
665 aa  513  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  9.7295e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3485  ATP-dependent metalloprotease  50.56 
 
 
647 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  1.63816e-10  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>