More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2777 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  54.41 
 
 
956 aa  1033    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  59.59 
 
 
971 aa  1168    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  55.77 
 
 
963 aa  1071    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 
975 aa  1987    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3593  PEP-utilising enzyme, mobile region  39.37 
 
 
1097 aa  691    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  59.38 
 
 
971 aa  1167    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  56 
 
 
959 aa  1043    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  27.33 
 
 
854 aa  195  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.19 
 
 
873 aa  194  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  27.22 
 
 
840 aa  194  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  25.79 
 
 
842 aa  190  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  26.22 
 
 
884 aa  187  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.22 
 
 
891 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  25.63 
 
 
868 aa  185  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  26.6 
 
 
826 aa  185  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  24.91 
 
 
842 aa  184  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  24.91 
 
 
842 aa  184  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  24.94 
 
 
903 aa  183  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  25.28 
 
 
868 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  25.28 
 
 
868 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  25.41 
 
 
868 aa  179  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  23.51 
 
 
889 aa  177  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  25.03 
 
 
852 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  25.61 
 
 
871 aa  168  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2689  phosphoenolpyruvate synthase  24.68 
 
 
871 aa  160  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.769187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  24.85 
 
 
869 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  24.26 
 
 
835 aa  142  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  22.48 
 
 
892 aa  140  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  23.31 
 
 
825 aa  137  9e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  28.86 
 
 
890 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  28.22 
 
 
891 aa  129  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  30.28 
 
 
837 aa  128  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  28.44 
 
 
874 aa  128  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  27.78 
 
 
867 aa  121  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.3 
 
 
887 aa  120  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  32.86 
 
 
788 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  26.88 
 
 
868 aa  119  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  27.91 
 
 
907 aa  119  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  28.34 
 
 
950 aa  118  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  27.14 
 
 
866 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  25.94 
 
 
869 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  26.69 
 
 
868 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  35.26 
 
 
906 aa  115  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  27.17 
 
 
870 aa  114  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  26.69 
 
 
821 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  26.25 
 
 
869 aa  114  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  35.83 
 
 
275 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  35.4 
 
 
971 aa  113  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  26.99 
 
 
865 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  25 
 
 
868 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  32.58 
 
 
868 aa  112  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2432  Pyruvate, water dikinase  36.51 
 
 
359 aa  112  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  31.85 
 
 
791 aa  109  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  30.14 
 
 
811 aa  108  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  31.65 
 
 
797 aa  106  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0511  hypothetical protein  28.29 
 
 
594 aa  105  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.493067  normal  0.202815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  35.66 
 
 
835 aa  104  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4241  hypothetical protein  30.77 
 
 
560 aa  104  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.57 
 
 
868 aa  104  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1184  PEP-utilising enzyme, mobile region  23.28 
 
 
592 aa  103  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.627285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  22.74 
 
 
887 aa  100  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  35.98 
 
 
765 aa  100  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.28 
 
 
302 aa  99.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  34.76 
 
 
886 aa  99.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23630  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  34.72 
 
 
386 aa  97.1  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  34.95 
 
 
754 aa  96.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  31.78 
 
 
758 aa  95.5  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.33 
 
 
810 aa  94.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1604  hypothetical protein  26.85 
 
 
602 aa  94  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  26.5 
 
 
758 aa  93.6  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  32.2 
 
 
758 aa  93.6  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  32.68 
 
 
757 aa  92.8  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.77 
 
 
386 aa  92.4  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1605  putative phosphoenolpyruvate synthase (pyruvate, water dikinase) (PEP synthase)  31.52 
 
 
364 aa  92.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  30.28 
 
 
758 aa  92  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  33.17 
 
 
788 aa  92  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  30.38 
 
 
414 aa  91.3  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  29.95 
 
 
758 aa  91.3  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2100  hypothetical protein  27.54 
 
 
609 aa  91.3  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  29.11 
 
 
781 aa  90.1  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1996  hypothetical protein  28.18 
 
 
622 aa  90.1  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0906204  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  32.54 
 
 
785 aa  89.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  30.37 
 
 
764 aa  89.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05843  phosphoenolpyruvate synthase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14790)  31.67 
 
 
911 aa  89  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.775081  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2043  PEP-utilising protein mobile region  25.57 
 
 
725 aa  89  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.80006  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  32.04 
 
 
761 aa  89  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.62 
 
 
902 aa  89  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  32.85 
 
 
762 aa  88.6  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2412  phosphoenolpyruvate-utilizing enzyme mobile domain protein  25.57 
 
 
708 aa  88.6  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  30.24 
 
 
769 aa  88.6  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  31.46 
 
 
761 aa  88.2  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  32.69 
 
 
762 aa  87.8  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  29.95 
 
 
758 aa  87.8  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  26.16 
 
 
885 aa  87.4  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4026  PEP-utilising enzyme, mobile region  30.27 
 
 
537 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.756461  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  29.28 
 
 
366 aa  87  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0174  pyruvate, water dikinase  34.62 
 
 
884 aa  87  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4575  PEP-utilising protein mobile region  34.23 
 
 
312 aa  86.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848155  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  26.82 
 
 
885 aa  87  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0459  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  32.14 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.817903  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>