More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47820 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  97.75 
 
 		 222 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  80.39 
 
 		 206 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  63.38 
 
 		 225 aa  292  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  63.21 
 
 		 226 aa  285  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  40.5 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 226 aa  166  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 223 aa  157  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  37.2 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  35.75 
 
 		 227 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  35.89 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 222 aa  144  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  34.83 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 222 aa  138  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 230 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  37.27 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 213 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 219 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 219 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  31.88 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  37.25 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 222 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 221 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4095  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0628  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  32.14 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 218 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 223 aa  95.5  6e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  30 
 
 		 245 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 230 aa  94.7  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 248 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  28.5 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3536  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 247 aa  92  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 226 aa  91.7  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>