More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_12820 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2100  two-component sensor protein  40.56 
 
 		 1211 aa  756    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  0.142111 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2113  PAS  43.08 
 
 		 1206 aa  915    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.819255  normal  0.387177 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0173  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 		 1191 aa  702    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3975  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.05 
 
 		 1214 aa  867    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1619  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 		 1201 aa  770    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278595  normal  0.0196406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1162  two-component sensor  82.3 
 
 		 1215 aa  2000    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3639  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.65 
 
 		 1210 aa  758    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.847136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12820  two-component sensor  100 
 
 		 1212 aa  2449    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0303  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 1196 aa  742    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.723835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1292  PAS  34.26 
 
 		 1209 aa  572  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.746783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1482  sensory box histidine kinase/response regulator  33.03 
 
 		 1213 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24720  putative two-component sensor  45.63 
 
 		 741 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2094  virulence sensor protein BvgS  46.38 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02280  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  28.95 
 
 		 1197 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1287  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.07 
 
 		 1197 aa  480  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02241  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1197 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2657  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  29.24 
 
 		 1197 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1299  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  28.95 
 
 		 1197 aa  480  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2507  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  28.93 
 
 		 1197 aa  479  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0203632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2520  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  29.7 
 
 		 1127 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2739  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  29.08 
 
 		 1197 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.485487  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3601  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  29.43 
 
 		 1127 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.317303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2326  extracellular solute-binding protein/sensory box protein  38.87 
 
 		 751 aa  465  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163187  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1642  putative PAS/PAC sensor protein  38.87 
 
 		 796 aa  459  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0928458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  30.92 
 
 		 1040 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2316  sensor histidine kinase/response regulator  50.41 
 
 		 477 aa  446  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.857648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1420  sensory box histidine kinase/response regulator  31.41 
 
 		 1199 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2161  sensor histidine kinase/response regulator  30.74 
 
 		 1286 aa  426  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1864  Hpt sensor hybrid histidine kinase  50.72 
 
 		 1069 aa  426  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0404414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2782  Hpt sensor hybrid histidine kinase  45.86 
 
 		 1091 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3413  Hpt sensor hybrid histidine kinase  46.45 
 
 		 1093 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.464366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2349  Hpt sensor hybrid histidine kinase  46.86 
 
 		 1093 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0868194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2527  Hpt sensor hybrid histidine kinase  46.44 
 
 		 1090 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120042  normal  0.0845157 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 		 1410 aa  345  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4472  PAS  39.85 
 
 		 679 aa  333  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.185936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 1199 aa  311  5.9999999999999995e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 		 1788 aa  309  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.81 
 
 		 1049 aa  304  8.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30700  putative sensor/response regulator hybrid  42.98 
 
 		 992 aa  301  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.716544  hitchhiker  0.000396049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 1165 aa  300  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4410  virulence sensor protein BvgS  44.15 
 
 		 948 aa  297  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  35.83 
 
 		 968 aa  284  6.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1612  histidine kinase  40.71 
 
 		 448 aa  279  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.786857  normal  0.263527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2957  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 		 810 aa  275  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.77 
 
 		 1055 aa  271  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 		 764 aa  268  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 916 aa  268  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 1195 aa  265  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 1611 aa  265  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 1433 aa  260  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.39 
 
 		 772 aa  258  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 		 1029 aa  258  7e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5844  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 		 948 aa  257  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.22 
 
 		 913 aa  254  6e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 		 863 aa  252  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.06 
 
 		 1127 aa  251  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 1622 aa  250  9e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 		 765 aa  249  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 1059 aa  248  6.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1002 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2366  histidine kinase  39.32 
 
 		 697 aa  244  9e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 881 aa  244  9e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 		 896 aa  243  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.79 
 
 		 1075 aa  243  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.53 
 
 		 763 aa  243  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 		 785 aa  243  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 982 aa  242  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 		 1309 aa  242  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  29.15 
 
 		 882 aa  241  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1259  sensory box sensor histidine kinase/response regulator VieS  25.86 
 
 		 1146 aa  241  5.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 		 1003 aa  241  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.05 
 
 		 678 aa  241  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00885051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  31.65 
 
 		 982 aa  240  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 		 606 aa  239  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3277  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 		 741 aa  239  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 		 843 aa  239  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.85 
 
 		 705 aa  238  6e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.82 
 
 		 865 aa  238  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 		 1313 aa  238  8e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 		 743 aa  237  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4228  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 		 1011 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2617  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 		 554 aa  236  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.4 
 
 		 1331 aa  235  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 		 939 aa  235  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 778 aa  235  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.87 
 
 		 882 aa  234  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000317  sensor protein TorS  33.52 
 
 		 987 aa  234  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.598131  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 1002 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.41 
 
 		 678 aa  233  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  29.61 
 
 		 1560 aa  233  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06119  histidine kinase  33.4 
 
 		 985 aa  233  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 877 aa  233  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0107  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.95 
 
 		 774 aa  233  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  38.68 
 
 		 651 aa  232  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 		 1266 aa  232  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  36.3 
 
 		 641 aa  232  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 		 965 aa  231  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 		 1158 aa  231  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2154  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 		 815 aa  231  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 		 803 aa  231  6e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>