More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2475 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011982  Avi_8162  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  63.85 
 
 
522 aa  711    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.164688  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2475  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
521 aa  1074    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0955412  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4335  extracellular solute-binding protein  49.33 
 
 
526 aa  501  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.83307  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4458  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  45.96 
 
 
526 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.124294  hitchhiker  0.0000632484 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4344  extracellular solute-binding protein  44.99 
 
 
526 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0239  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 
529 aa  197  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.01 
 
 
510 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  28.66 
 
 
520 aa  171  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 
516 aa  169  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.98 
 
 
521 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.98 
 
 
521 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.98 
 
 
521 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.98 
 
 
521 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 
521 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 
528 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 
512 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  29.61 
 
 
505 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 
512 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 
512 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 
493 aa  161  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
510 aa  160  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.68 
 
 
512 aa  160  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.66 
 
 
521 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0426  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 
522 aa  157  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 
521 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  30.22 
 
 
503 aa  155  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0504  ABC transporter substrate-binding protein  30.07 
 
 
531 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.325614  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5235  extracellular solute-binding protein family 5  30.98 
 
 
522 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4491  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 
509 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  29.57 
 
 
526 aa  154  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
498 aa  154  5e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  28.06 
 
 
516 aa  152  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  28.76 
 
 
544 aa  152  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  28.37 
 
 
509 aa  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 
532 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  29.74 
 
 
522 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 
515 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  28.98 
 
 
525 aa  150  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
520 aa  150  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  29.04 
 
 
544 aa  149  9e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  31.63 
 
 
533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3787  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 
531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.216169  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  27.14 
 
 
540 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.33 
 
 
540 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
549 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 
528 aa  148  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5662  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 
544 aa  148  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76313 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2622  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 
517 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.558753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  31.63 
 
 
531 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0626  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 
510 aa  147  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.797506  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  28.71 
 
 
533 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  29.09 
 
 
533 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
540 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 
538 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  30.18 
 
 
530 aa  146  9e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.41 
 
 
538 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 
510 aa  145  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  27.45 
 
 
523 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  27.29 
 
 
535 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1769  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 
589 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  28.63 
 
 
531 aa  144  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  28.25 
 
 
522 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  27.01 
 
 
523 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  29.3 
 
 
525 aa  141  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  29.04 
 
 
519 aa  141  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2633  twin-arginine translocation pathway signal  29.09 
 
 
515 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.192046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  28.7 
 
 
532 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.16 
 
 
542 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 
516 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  27.84 
 
 
516 aa  140  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.25 
 
 
502 aa  140  7e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  29.41 
 
 
508 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
595 aa  139  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  28.23 
 
 
556 aa  139  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
538 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.16 
 
 
526 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.29 
 
 
520 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  29.16 
 
 
526 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  29.16 
 
 
526 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0836  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.01 
 
 
520 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.385717  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  31.16 
 
 
517 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 
515 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  27.56 
 
 
532 aa  138  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4010  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.94 
 
 
526 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 
553 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3130  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 
520 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777715  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  28.94 
 
 
526 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.08 
 
 
511 aa  137  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0813  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
531 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125368  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  28.04 
 
 
524 aa  136  8e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.32 
 
 
542 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  26.82 
 
 
516 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.29 
 
 
509 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  27.18 
 
 
514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0049  extracellular solute-binding protein family 5  25.79 
 
 
535 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.46848  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  27.36 
 
 
520 aa  135  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  28.96 
 
 
527 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
518 aa  133  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3490  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 
529 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>