90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0863 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_1977  DNA polymerase III subunit delta  89.34 
 
 		 388 aa  638    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.286095  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0863  DNA polymerase III subunit delta  100 
 
 		 347 aa  694    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2057  DNA polymerase III subunit delta  90.2 
 
 		 347 aa  644    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0050  DNA polymerase III subunit delta  54.6 
 
 		 347 aa  393  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3317  DNA polymerase III subunit delta  53.31 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4252  DNA polymerase III subunit delta  40.29 
 
 		 346 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.400931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3200  DNA polymerase III subunit delta  41.98 
 
 		 343 aa  281  9e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3926  DNA polymerase III subunit delta  39.71 
 
 		 346 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4384  DNA polymerase III subunit delta  39.19 
 
 		 347 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  38.86 
 
 		 342 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1024  DNA polymerase III subunit delta  38.62 
 
 		 342 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0292  DNA polymerase III subunit delta  38.15 
 
 		 343 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.259297  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1448  DNA polymerase III subunit delta  36.31 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  37.46 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  36.44 
 
 		 342 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  37.46 
 
 		 342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1652  DNA polymerase III subunit delta  37.97 
 
 		 343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.884155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1587  DNA polymerase III subunit delta  37.97 
 
 		 343 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0083136 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0387  DNA polymerase III subunit delta  36.23 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.252909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1866  DNA polymerase III subunit delta  37.68 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1406  DNA polymerase III subunit delta  39.08 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  32.85 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4096  DNA polymerase III subunit delta  35.19 
 
 		 345 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.327315  normal  0.0146653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0339  DNA polymerase III, delta subunit  35.45 
 
 		 338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00729017 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0222  DNA polymerase III, delta subunit  33.73 
 
 		 340 aa  170  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  0.129327 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3629  DNA polymerase III subunit delta  34.58 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.628858  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0639  DNA polymerase III subunit delta  32.13 
 
 		 337 aa  162  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.858672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1278  DNA polymerase III subunit delta  35.34 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2048  DNA polymerase III subunit delta  31.47 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.296688  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2959  DNA polymerase III, delta subunit  29.35 
 
 		 350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0077  DNA polymerase III, delta subunit  23.62 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0126  hypothetical protein  24.32 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3217  DNA polymerase III, delta subunit  26.69 
 
 		 340 aa  90.5  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5028  DNA polymerase III subunit delta  28.28 
 
 		 350 aa  86.3  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2850  DNA polymerase III, delta subunit  29.01 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.160345  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2767  DNA polymerase III, delta subunit  25.8 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0364  hypothetical protein  22.08 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  24.76 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  23.97 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0043  DNA polymerase III, delta subunit  24.56 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  28.02 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  24.16 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  24.01 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  24.34 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  24.34 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  23.93 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  23 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  22.26 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1720  DNA polymerase III, delta subunit  22.41 
 
 		 354 aa  57  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  24.77 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0055  DNA polymerase III, delta subunit  25.66 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000100325 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  24.05 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2277  DNA-directed DNA polymerase  27.73 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  22.36 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1404  DNA polymerase III, delta subunit  28.34 
 
 		 389 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.162572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0513  DNA polymerase III, delta subunit  24.28 
 
 		 338 aa  52.8  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  24.8 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2663  DNA polymerase III, delta subunit  23.58 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193878  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  24.22 
 
 		 345 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  24.49 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0542  DNA polymerase III subunit delta  24.32 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0409  DNA polymerase III, delta subunit  24.18 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  24.72 
 
 		 345 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  26.32 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  24.52 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2832  DNA polymerase III subunit delta  23.79 
 
 		 352 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0703  DNA polymerase III, delta subunit  19.38 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000446236  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3313  DNA polymerase III, delta subunit  21.24 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000619829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3146  DNA polymerase III subunit delta  28.49 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3018  DNA polymerase III, delta subunit  22.67 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1096  DNA polymerase III, delta subunit  21.24 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00712318  hitchhiker  0.000000000697762 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3449  DNA polymerase III, delta subunit  21.24 
 
 		 343 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0222652  hitchhiker  0.000721711 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3271  DNA polymerase III, delta subunit  21.24 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00947649  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  23.6 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2981  DNA polymerase III subunit delta  25.51 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1185  DNA polymerase III subunit delta  27.96 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.37813  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2346  DNA polymerase III subunit delta  24.18 
 
 		 352 aa  46.2  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.21014  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0402  DNA polymerase III, delta subunit  29.3 
 
 		 338 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.745977  normal  0.62254 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2571  DNA polymerase III subunit delta  25.51 
 
 		 358 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225423  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0999  DNA polymerase III, delta subunit  22.41 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000304897  normal  0.119076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2931  DNA polymerase III, delta subunit  21.09 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.118412  decreased coverage  0.00725914 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1060  DNA polymerase III, delta subunit  22.41 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0315108  hitchhiker  0.00717458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0995  DNA polymerase III, delta subunit  21.99 
 
 		 343 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0109002  normal  0.117484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2960  DNA polymerase III subunit delta  23.81 
 
 		 343 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2742  DNA polymerase III subunit delta  23.65 
 
 		 358 aa  43.5  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2157  DNA polymerase III, delta subunit  22.71 
 
 		 338 aa  43.5  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  24.18 
 
 		 338 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2143  DNA polymerase III, delta subunit  26.75 
 
 		 334 aa  43.1  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0838  DNA polymerase III, delta subunit  27.6 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1213  DNA polymerase III subunit delta  27.73 
 
 		 362 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>