More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0440 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  100 
 
 		 470 aa  927    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  90.79 
 
 		 471 aa  844    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  90.58 
 
 		 471 aa  843    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  59.16 
 
 		 468 aa  522  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  52.26 
 
 		 460 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  52.54 
 
 		 472 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  53.85 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  52.73 
 
 		 470 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2521  multi anti extrusion protein MatE  51.23 
 
 		 490 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.200402 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  47.39 
 
 		 477 aa  394  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  40.57 
 
 		 467 aa  332  9e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0643  MATE efflux family protein  41.76 
 
 		 477 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.26876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0664  MATE efflux family protein  42.11 
 
 		 472 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.253686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0676  MATE efflux family protein  42.11 
 
 		 472 aa  319  5e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.441843  normal  0.0136882 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  39.57 
 
 		 467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0033  MATE efflux family protein  40.18 
 
 		 463 aa  302  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  37.36 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2708  MATE efflux family protein  39.52 
 
 		 467 aa  299  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  37.11 
 
 		 460 aa  296  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  38.1 
 
 		 472 aa  294  2e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  38.61 
 
 		 474 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  36.91 
 
 		 458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  38.83 
 
 		 470 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  39.86 
 
 		 460 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  39.45 
 
 		 451 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  39.45 
 
 		 451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  37.21 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  39.6 
 
 		 462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  39.46 
 
 		 462 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  39.46 
 
 		 462 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  39.46 
 
 		 462 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  39.42 
 
 		 462 aa  273  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  39.42 
 
 		 462 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  37.85 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  38.85 
 
 		 453 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  38.03 
 
 		 463 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  38.93 
 
 		 462 aa  269  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  38.1 
 
 		 470 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  38.16 
 
 		 470 aa  266  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  35.84 
 
 		 464 aa  262  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  35.29 
 
 		 468 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  35.29 
 
 		 468 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  35.29 
 
 		 468 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 468 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  35.29 
 
 		 468 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  35.29 
 
 		 468 aa  260  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  35.29 
 
 		 468 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  36.72 
 
 		 469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  34.69 
 
 		 462 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  36.04 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  35.15 
 
 		 462 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1699  MATE efflux family protein  34.9 
 
 		 462 aa  233  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.4571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  33.94 
 
 		 464 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  35.15 
 
 		 462 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  34.92 
 
 		 462 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04042  multidrug efflux protein  33.79 
 
 		 441 aa  227  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  35.24 
 
 		 462 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  35.65 
 
 		 488 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  29.07 
 
 		 460 aa  220  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  33.26 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  33.77 
 
 		 466 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  29.53 
 
 		 466 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  30 
 
 		 457 aa  206  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  30 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  30 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  32.58 
 
 		 460 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  30.91 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  34.48 
 
 		 486 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  28.38 
 
 		 457 aa  202  9.999999999999999e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2236  multidrug efflux protein  32.17 
 
 		 453 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3598  multidrug efflux protein  33.85 
 
 		 454 aa  199  6e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  27.38 
 
 		 460 aa  199  9e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  29.57 
 
 		 450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  28.92 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  29.18 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2146  multidrug efflux protein  31.67 
 
 		 453 aa  197  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  30.13 
 
 		 457 aa  193  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  30.36 
 
 		 457 aa  193  7e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  29.93 
 
 		 457 aa  192  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  29.75 
 
 		 457 aa  192  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  29 
 
 		 458 aa  192  9e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  29.36 
 
 		 458 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  29.69 
 
 		 457 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  30.16 
 
 		 477 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  28.89 
 
 		 459 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  30.16 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  29.53 
 
 		 478 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 459 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2334  MATE efflux family protein  28.22 
 
 		 459 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0215455  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  28.05 
 
 		 454 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2180  MATE efflux family protein  28.67 
 
 		 459 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00809884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  27.58 
 
 		 456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  30.75 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  29.91 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  27.52 
 
 		 452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  30.75 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  30.75 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  30.75 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>