230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0058 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  701    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  72.51 
 
 
334 aa  512  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  72.22 
 
 
351 aa  511  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  49.42 
 
 
327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  44.19 
 
 
337 aa  286  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  46.25 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  45.77 
 
 
320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4444  hypothetical protein  46.41 
 
 
328 aa  256  5e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512489  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  42.04 
 
 
323 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  43.43 
 
 
319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  40.36 
 
 
324 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  40.26 
 
 
321 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6066  hypothetical protein  39.22 
 
 
318 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0341315  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  39.39 
 
 
365 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  38.94 
 
 
357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  39.09 
 
 
357 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  33.73 
 
 
302 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  46.94 
 
 
178 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7626  hypothetical protein  46.38 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  50.32 
 
 
173 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2255  hypothetical protein  40.37 
 
 
170 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.347507  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2200  hypothetical protein  48.61 
 
 
176 aa  126  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.276125  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2595  nuclear export factor GLE1  44.16 
 
 
176 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258985  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  41.57 
 
 
184 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1867  hypothetical protein  52.54 
 
 
178 aa  125  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0951087  normal  0.135691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  54.55 
 
 
175 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3279  protein of unknown function DUF461  47.13 
 
 
179 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3278  nuclear export factor GLE1  42.28 
 
 
176 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  37.65 
 
 
175 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  49.59 
 
 
172 aa  116  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2424  hypothetical protein  47.01 
 
 
174 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0361451  normal  0.0654459 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3206  hypothetical protein  41.91 
 
 
167 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2103  protein of unknown function DUF461  43.84 
 
 
165 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1330  hypothetical protein  42.62 
 
 
172 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.318771  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0418  hypothetical protein  46.32 
 
 
185 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306476  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  47.69 
 
 
157 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  41.18 
 
 
180 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  45.38 
 
 
150 aa  107  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  37.91 
 
 
177 aa  106  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  40.13 
 
 
176 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  36.78 
 
 
196 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1379  hypothetical protein  45 
 
 
174 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0158945  hitchhiker  0.0000523836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1654  protein of unknown function DUF461  45 
 
 
174 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230933  normal  0.946268 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4130  hypothetical protein  38.97 
 
 
160 aa  100  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0361721  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  36.64 
 
 
184 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1374  protein of unknown function DUF461  41.01 
 
 
181 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0071254  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2476  hypothetical protein  39.66 
 
 
156 aa  99.4  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0754  nuclear export factor GLE1  35 
 
 
245 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0129981 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1335  hypothetical protein  39.55 
 
 
199 aa  96.7  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  41.22 
 
 
191 aa  95.5  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0137  hypothetical protein  41.43 
 
 
162 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2585  hypothetical protein  42.86 
 
 
170 aa  93.6  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000482687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  43.12 
 
 
203 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2286  hypothetical protein  42.14 
 
 
164 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0250797  hitchhiker  0.000850199 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  38.06 
 
 
149 aa  93.2  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1996  hypothetical protein  43.41 
 
 
154 aa  93.2  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000352963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  37.97 
 
 
176 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  41.91 
 
 
159 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  48.6 
 
 
156 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  42.54 
 
 
167 aa  91.3  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2181  hypothetical protein  41.32 
 
 
167 aa  90.5  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2890  hypothetical protein  36.09 
 
 
166 aa  90.1  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0174  hypothetical protein  39.01 
 
 
158 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181733  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3343  hypothetical protein  45.76 
 
 
162 aa  89.7  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0788741 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0617  hypothetical protein  40.98 
 
 
171 aa  89.4  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  41.8 
 
 
155 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  43.14 
 
 
204 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1360  hypothetical protein  41.67 
 
 
151 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399009  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2691  protein of unknown function DUF461  46.94 
 
 
162 aa  87.4  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  40.68 
 
 
158 aa  87.4  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1514  hypothetical protein  41.88 
 
 
165 aa  87.8  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.514897  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0038  putative transmembrane protein  39.34 
 
 
167 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3713  protein of unknown function DUF461  42.86 
 
 
164 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0598  hypothetical protein  39.34 
 
 
159 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.338306  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3390  protein of unknown function DUF461  41.96 
 
 
165 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  32.7 
 
 
264 aa  87  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1066  nuclear export factor GLE1  33.88 
 
 
243 aa  86.7  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.614855  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  43.18 
 
 
158 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  43 
 
 
158 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2881  hypothetical protein  40.34 
 
 
142 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.71435  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1987  hypothetical protein  41.22 
 
 
160 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  37.07 
 
 
162 aa  84  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1210  hypothetical protein  44.86 
 
 
149 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  34.75 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  36.76 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0673  hypothetical protein  44.66 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0451444  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  37.86 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  36.36 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2609  hypothetical protein  41.32 
 
 
162 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0189844  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1893  hypothetical protein  39.69 
 
 
162 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0525  hypothetical protein  39.47 
 
 
170 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527172  hitchhiker  0.00000658368 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  37.07 
 
 
145 aa  82  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1764  hypothetical protein  40 
 
 
195 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  39.05 
 
 
187 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1994  hypothetical protein  36.52 
 
 
161 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000011396 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  36.73 
 
 
166 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4932  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  38.14 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4676  hypothetical protein  38.33 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.742423  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1330  hypothetical protein  31.34 
 
 
158 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>