More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2540 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 147 aa  294  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04886  pilin  53.47 
 
 		 141 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.969324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  50.68 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  44.68 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  44.91 
 
 		 169 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  45.32 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  43.37 
 
 		 179 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  40.36 
 
 		 179 aa  98.6  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  46.62 
 
 		 148 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  40.48 
 
 		 168 aa  97.1  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1890  hypothetical protein  54.93 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0864  peptidase S49, protease IV  47.55 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  40.36 
 
 		 169 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  39.6 
 
 		 138 aa  94.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1879  hypothetical protein  52.82 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  40.11 
 
 		 170 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  40.36 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  40.99 
 
 		 168 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  42.45 
 
 		 137 aa  91.3  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  43.45 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  42.42 
 
 		 165 aa  90.5  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  39.23 
 
 		 198 aa  90.5  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  39.23 
 
 		 198 aa  90.5  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  38.85 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  39.52 
 
 		 174 aa  87.4  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  69.49 
 
 		 173 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  67.21 
 
 		 178 aa  86.3  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  42.25 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  39.16 
 
 		 207 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  43.7 
 
 		 199 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  37.76 
 
 		 207 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  37.82 
 
 		 198 aa  84.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  36.18 
 
 		 198 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  36.18 
 
 		 198 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  36.18 
 
 		 198 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  56.1 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  45 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  68.42 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  34.71 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  37.33 
 
 		 205 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0230  Fimbrial protein pilin  47.12 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  73.08 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0820  putative type IV pilin protein PilA  40.26 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0278  type IV pilin, putative  40.26 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0816  putative type IV pilin protein PilA  40.26 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  55.74 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  36.13 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  72.55 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0979  PilA  40.52 
 
 		 207 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2398  putative type IV pilin  40.52 
 
 		 207 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558979  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  49.49 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  34.19 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2678  putative type IV pilin  40.52 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0011  putative type IV pilin  40.52 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  51.16 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  64.29 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  43.38 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0269  fimbrial protein pilin  42.57 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372108  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  39.39 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  58.46 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  37.98 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0649  pilin family protein  46.67 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  71.15 
 
 		 148 aa  72  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  69.09 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  60.66 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  61.11 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3575  putative major pilin subunit  34.53 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  65 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  34.38 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0666  putative major pilin subunit  39.6 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4781  Tfp pilus assembly protein  34.97 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  53.42 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  53.03 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3782  methylation site containing protein  41.13 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0473  fimbrial protein pilin  37.14 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  65.91 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0014  type IV pilin structural subunit  48.03 
 
 		 178 aa  67  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0111  putative major pilin subunit  34.43 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.273778  normal  0.482641 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.96 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3370  putative major pilin subunit  34.65 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.981789  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1041  putative major pilin subunit  34.65 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.131052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3498  putative major pilin subunit  34.65 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00107  predicted major pilin subunit  34.43 
 
 		 146 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3494  putative major pilin subunit  34.43 
 
 		 146 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  30.91 
 
 		 446 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0110  putative major pilin subunit  34.43 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000976692  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  30.91 
 
 		 438 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00106  hypothetical protein  34.43 
 
 		 146 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  58.82 
 
 		 142 aa  66.6  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3551  putative major pilin subunit  34.43 
 
 		 146 aa  66.6  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0114  putative major pilin subunit  34.43 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00878541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  73.17 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  50.91 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  54.55 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  62.75 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  35.71 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0161  putative major pilin subunit  33.33 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  38.71 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0158  putative major pilin subunit  33.33 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.320147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  56 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>