272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0668 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 458 aa  939    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  66.08 
 
 		 457 aa  600  1e-170  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  57.42 
 
 		 458 aa  519  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  56.96 
 
 		 467 aa  514  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  57.17 
 
 		 456 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2778  geranylgeranyl reductase  57.55 
 
 		 471 aa  498  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  56.26 
 
 		 455 aa  488  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  41.72 
 
 		 495 aa  353  4e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  32.21 
 
 		 453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  32.16 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  31.46 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  30.89 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  26.5 
 
 		 453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  30.31 
 
 		 408 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  26.54 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  29.8 
 
 		 406 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  27.39 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  23.74 
 
 		 485 aa  107  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.69 
 
 		 395 aa  106  8e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  27.44 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  27.83 
 
 		 390 aa  98.2  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  29.24 
 
 		 399 aa  98.2  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.65 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.67 
 
 		 376 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.58 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.97 
 
 		 384 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  31.04 
 
 		 398 aa  95.1  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  27.78 
 
 		 397 aa  94.4  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.7 
 
 		 390 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.2 
 
 		 390 aa  90.5  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  27.19 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  28.42 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.88 
 
 		 390 aa  87.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.15 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  27.68 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  29.04 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  30.71 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  27.07 
 
 		 393 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  26.86 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26.52 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.07 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  25.46 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.93 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  24.74 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.2 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0574  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  22.99 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  25.92 
 
 		 413 aa  69.7  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.61 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  28.19 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  25.06 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  25.63 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  26.3 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  24.47 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  24.86 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.44 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  25.56 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0086  putative oxidoreductase FixC  26.08 
 
 		 428 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0087  putative oxidoreductase FixC  26.08 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0083  putative oxidoreductase FixC  26.08 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0083  putative oxidoreductase FixC  26.08 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.715205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0084  putative oxidoreductase FixC  26.08 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  25.17 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3556  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  29.84 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  29.18 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  26.51 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3460  geranylgeranyl reductase  25.72 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  25.48 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  26.82 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  23.12 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  23.63 
 
 		 377 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  25.3 
 
 		 506 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  24.34 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1027  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  27.07 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1195  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  26.9 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  24.23 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  24.26 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  24.02 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  26.68 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0047  putative oxidoreductase FixC  27.2 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  24.33 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  24.17 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.6 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.678719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>