More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0350 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0350  inner-membrane translocator  100 
 
 		 292 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.018915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  79.79 
 
 		 292 aa  475  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1742  inner-membrane translocator  84.25 
 
 		 292 aa  474  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0350501  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4242  inner-membrane translocator  82.19 
 
 		 292 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3557  inner-membrane translocator  83.22 
 
 		 292 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  57.53 
 
 		 290 aa  325  7e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  58.22 
 
 		 290 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4711  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23000  branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  43.05 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.135077  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.97 
 
 		 290 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1781  ABC transporter permease  40.78 
 
 		 287 aa  192  7e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0603975  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0430  inner-membrane translocator  43.39 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0151823  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 292 aa  162  9e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3010  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000508141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  35.64 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  33.67 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4592  inner-membrane translocator  37.27 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  32.2 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  31.17 
 
 		 309 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.33 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  33.9 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0356  inner-membrane translocator  34 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  31.72 
 
 		 287 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  33.77 
 
 		 294 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  30.98 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  31.73 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3583  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 289 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.967515  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 338 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_816  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.72 
 
 		 294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.648564  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0945  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  30.39 
 
 		 294 aa  129  6e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0829  inner-membrane translocator  30.39 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0086  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 294 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2969  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.968698  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0086  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285698  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  32.43 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  31.07 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0104  inner-membrane translocator  32.63 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.503861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  35.52 
 
 		 291 aa  125  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2937  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 		 287 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3268  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.93 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0505  inner-membrane translocator  29.11 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0978839  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.99 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3912  inner-membrane translocator  31.93 
 
 		 294 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.99 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1606  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0088  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.99 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3374  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0197  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  31.99 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  31.05 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.99 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0020  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.23 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  29.32 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  29.87 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3989  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  29.19 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0077  inner-membrane translocator  30.88 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2996  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4063  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  31.23 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.91 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  32.89 
 
 		 301 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  28.99 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  31.17 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1651  inner-membrane translocator  36.3 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 301 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3328  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.34 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  31.29 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  30.64 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3210  inner-membrane translocator  30.99 
 
 		 294 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0914  inner-membrane translocator  34.33 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 291 aa  122  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30.96 
 
 		 316 aa  122  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1558  inner-membrane translocator  29.9 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2768  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein, putative  31.42 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0848238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2986  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3707  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.67 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  29.57 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>