284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1950 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 255 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  46.77 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  50.76 
 
 		 361 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 301 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 304 aa  118  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  49.29 
 
 		 305 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 298 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  32.23 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07700  NTP pyrophosphohydrolase  35.85 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.054443  normal  0.43952 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  31.58 
 
 		 141 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0181  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.463444  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0762  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  54.9 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  31.58 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 141 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 141 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 141 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  32.33 
 
 		 141 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  30.83 
 
 		 141 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  32.33 
 
 		 141 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  37.37 
 
 		 153 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  31.58 
 
 		 141 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 149 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  44.62 
 
 		 142 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  31.58 
 
 		 141 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 137 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 		 179 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0197  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 137 aa  53.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.19554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 158 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 149 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3392  hydrolase, NUDIX family  32.2 
 
 		 120 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2535  NUDIX family hydrolase  30.83 
 
 		 141 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 134 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2405  NUDIX family hydrolase  31.36 
 
 		 120 aa  52.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 155 aa  52.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 144 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  43.08 
 
 		 141 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3512  mutator mutT protein  40.54 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3657  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 147 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  0.460753 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 150 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 147 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 340 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 		 155 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  47.17 
 
 		 149 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  49.02 
 
 		 334 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.48 
 
 		 135 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3245  mutator mutT protein  39.19 
 
 		 149 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  39.19 
 
 		 149 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 140 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  50.98 
 
 		 347 aa  48.9  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  39.19 
 
 		 149 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  39.19 
 
 		 149 aa  49.3  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 172 aa  48.9  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  49.02 
 
 		 149 aa  48.9  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  33.57 
 
 		 158 aa  48.9  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 139 aa  48.9  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 141 aa  48.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  36.49 
 
 		 140 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  44.93 
 
 		 144 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 		 164 aa  48.5  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 		 142 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 156 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.03 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  37.07 
 
 		 173 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  42.03 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  45.59 
 
 		 132 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.03 
 
 		 135 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 		 134 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.03 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  41.07 
 
 		 132 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  41.07 
 
 		 132 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  42.37 
 
 		 130 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  45.59 
 
 		 132 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  33.33 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 132 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  37.18 
 
 		 140 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 168 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 		 134 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  30.43 
 
 		 181 aa  47  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 		 151 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2491  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 138 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0097  hypothetical protein  32.2 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 156 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 173 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 147 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>