96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0097 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0097  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  588  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  61.33 
 
 
170 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  35.89 
 
 
291 aa  152  7e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  35.07 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  33.45 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1033  NUDIX hydrolase  49.67 
 
 
161 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.997989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
335 aa  129  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4393  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 
160 aa  125  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  43.51 
 
 
484 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  43.42 
 
 
475 aa  125  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 
174 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 
174 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 
174 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3752  NUDIX hydrolase  48.1 
 
 
156 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  47.74 
 
 
165 aa  122  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  42.94 
 
 
181 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  43.67 
 
 
217 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  33.81 
 
 
305 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0837  NUDIX hydrolase  40 
 
 
176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172365  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  40.41 
 
 
153 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0199  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 
180 aa  106  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0706  NUDIX hydrolase  42.41 
 
 
179 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0747129 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2056  NUDIX hydrolase  41.29 
 
 
165 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000128394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2308  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 
167 aa  95.9  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000433057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2026  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0458229  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  33.58 
 
 
314 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  29.13 
 
 
153 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  28.35 
 
 
153 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  28.35 
 
 
153 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  28.35 
 
 
153 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
151 aa  48.9  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 
153 aa  49.3  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  28.35 
 
 
153 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
153 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  39.68 
 
 
153 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  39.68 
 
 
229 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  39.68 
 
 
153 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  32.84 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2649  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 
209 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0213367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  45.61 
 
 
159 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  45.61 
 
 
159 aa  47  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
255 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  43.75 
 
 
131 aa  46.6  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  32.12 
 
 
314 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  40.62 
 
 
130 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1957  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  28.7 
 
 
137 aa  45.8  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.892636  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
156 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0240  mutator mutT protein  28.7 
 
 
137 aa  45.8  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.611039  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  44 
 
 
130 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  44 
 
 
130 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
158 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  29.13 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  30.34 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 
149 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  47.73 
 
 
132 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  42.86 
 
 
149 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 
149 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  47.73 
 
 
132 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 
140 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 
149 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  47.73 
 
 
132 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  44 
 
 
130 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
206 aa  45.8  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  28.69 
 
 
129 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  46.81 
 
 
129 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  31.43 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  50 
 
 
129 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
155 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  34 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  25 
 
 
140 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
155 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
140 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  27.62 
 
 
128 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  30.43 
 
 
132 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  30.43 
 
 
132 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 
158 aa  43.9  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  24.78 
 
 
156 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  24.78 
 
 
156 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  41.07 
 
 
149 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  51.22 
 
 
134 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  41.07 
 
 
149 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
252 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  47.62 
 
 
131 aa  43.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  42.86 
 
 
134 aa  42.7  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  43.48 
 
 
130 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  31.25 
 
 
318 aa  43.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
240 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
153 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  43.64 
 
 
154 aa  42.7  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
239 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
239 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
157 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  43.64 
 
 
154 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>