75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0024 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0024  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 299 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  32.88 
 
 		 297 aa  132  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0560  permeases-like  32.36 
 
 		 297 aa  119  9e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00020008  normal  0.118389 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0853  Auxin Efflux Carrier  34.51 
 
 		 297 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2022  Auxin Efflux Carrier  23.02 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  29.84 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  29.85 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  29.85 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  29.85 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  29.85 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0520  Auxin Efflux Carrier  29.3 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000302523  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  29.76 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  27.69 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  26.26 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  26.96 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  26.96 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  27.09 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  26.78 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  28.23 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  23.84 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  24.21 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  23.11 
 
 		 321 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 318 aa  51.6  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.15 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  23.45 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1840  hypothetical protein  20.08 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0212  putative transporter  25.26 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  24.07 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  25.95 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  28.17 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  27.78 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  25.54 
 
 		 318 aa  50.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  25.77 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0695  auxin efflux carrier  27.52 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.229992  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  25.44 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  22.98 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  30.11 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  24.61 
 
 		 319 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0719  auxin efflux carrier  27.13 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.224926  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  28.02 
 
 		 291 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 314 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  29.55 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2325  hypothetical protein  21.13 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2284  hypothetical protein  21.13 
 
 		 302 aa  46.2  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  27.75 
 
 		 307 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  26.35 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  22.54 
 
 		 310 aa  45.8  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0718  Auxin Efflux Carrier  28.66 
 
 		 318 aa  45.8  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1750  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  25.86 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  25.34 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  24.04 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  28.06 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  31.75 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  28.11 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  25.88 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  27.76 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  26.95 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  25.81 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  26.51 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  25.79 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 367 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  27.14 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  28.21 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  25.48 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  30.97 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  28.42 
 
 		 315 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  23.65 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  24.19 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  21.95 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  25.78 
 
 		 306 aa  42.7  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  26.21 
 
 		 311 aa  42.4  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  27.57 
 
 		 297 aa  42.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>