More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1596 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  100 
 
 		 339 aa  686    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  43.56 
 
 		 409 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  34.19 
 
 		 429 aa  183  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  37.63 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  32.56 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  33.19 
 
 		 354 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  32.64 
 
 		 354 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  33.2 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  34.87 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  33.2 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0185  periplasmic binding protein  28.85 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0952847  normal  0.560438 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  34.08 
 
 		 483 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  30.17 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  29.65 
 
 		 354 aa  116  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0286  periplasmic binding protein  30.97 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.234357  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  30.8 
 
 		 478 aa  110  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0836  periplasmic binding protein  29.51 
 
 		 397 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00603144  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  28.29 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0435  periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 362 aa  96.7  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000278634  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0342  periplasmic binding protein  28.96 
 
 		 267 aa  93.2  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.102535  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.49 
 
 		 375 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  28.97 
 
 		 358 aa  86.3  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  30.29 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1321  periplasmic binding protein  27.16 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.77394  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1314  periplasmic binding protein  27.23 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0394754 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.69 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  28.51 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1316  periplasmic binding protein  26.36 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.867732  normal  0.0135564 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  28.51 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  24.43 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  25.44 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  26.16 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  25.41 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  31.33 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  27.63 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  23.79 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  25.31 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2309  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.66047  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  27.39 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1830  periplasmic binding protein  29.74 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  28.45 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  27.51 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  26.58 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  23.17 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  27.35 
 
 		 317 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  25.39 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1720  periplasmic binding protein  23.56 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.740964  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  23.73 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  25 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  25.59 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  25.66 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0848  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2869  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.32 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  23.24 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4715  periplasmic binding protein  28.11 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  27 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3174  periplasmic binding protein  26.24 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1001  periplasmic binding protein  23.93 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  26.25 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  24.71 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1923  periplasmic binding protein  26.61 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  27 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0186  periplasmic binding protein  25.11 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  25.88 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  26.32 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.83 
 
 		 381 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  25.18 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7105  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  26.62 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.320123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  26.02 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  25.78 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  28.07 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  25 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.83 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0719  periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 274 aa  62  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  25.83 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.97 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0493  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  25.68 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  27.56 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0547  periplasmic binding protein  24.68 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  23.02 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  26.07 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3709  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.57 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1145  periplasmic binding protein  28.17 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.676996  normal  0.936441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2468  periplasmic binding protein  24.43 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.208513  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0561  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  26.44 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3605  periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  26.27 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.9 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  24.28 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>