More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3237 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
378 aa  726    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2014  peptidase M48 Ste24p  60.83 
 
 
378 aa  364  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.700955  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2290  peptidase M48 Ste24p  59.1 
 
 
378 aa  363  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1976  peptidase M48 Ste24p  59.22 
 
 
373 aa  354  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.88766  normal  0.175052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  41.9 
 
 
359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  37.77 
 
 
383 aa  186  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  33.81 
 
 
336 aa  106  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  34.31 
 
 
354 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  31.16 
 
 
364 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  30.57 
 
 
357 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  31.53 
 
 
361 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  33.5 
 
 
278 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  32.01 
 
 
358 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  32.2 
 
 
341 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  33.46 
 
 
362 aa  99.4  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.25 
 
 
264 aa  98.2  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  29.23 
 
 
347 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  29.94 
 
 
343 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  32.94 
 
 
363 aa  97.8  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  31.96 
 
 
347 aa  96.3  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3510  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  28.04 
 
 
370 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  31.11 
 
 
349 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  29.39 
 
 
345 aa  93.2  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  29.05 
 
 
345 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  31.47 
 
 
327 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
548 aa  90.5  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  24.66 
 
 
367 aa  90.5  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  38.39 
 
 
352 aa  90.5  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  32.11 
 
 
395 aa  89  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  28.38 
 
 
331 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  30.08 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  36.19 
 
 
444 aa  87.8  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  33.98 
 
 
374 aa  87.4  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  34.11 
 
 
377 aa  87  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  32.09 
 
 
383 aa  86.3  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  33.61 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  32.6 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  33.54 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  29.79 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  32.94 
 
 
553 aa  84  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5225  peptidase M48 Ste24p  27.07 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.32225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  38.19 
 
 
349 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  32.91 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  33.47 
 
 
514 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  32.52 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  32.33 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  33.04 
 
 
549 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  31.82 
 
 
504 aa  81.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  37.09 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  28.93 
 
 
605 aa  79.3  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  31.52 
 
 
436 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0070  peptidase M48 Ste24p  24.65 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.885024  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0072  peptidase M48 Ste24p  24.65 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  32.81 
 
 
554 aa  76.3  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  33 
 
 
533 aa  76.3  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  29.87 
 
 
348 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  28.69 
 
 
573 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  31.62 
 
 
521 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  31.62 
 
 
521 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  33.33 
 
 
479 aa  74.3  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  29.55 
 
 
541 aa  73.2  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  29.66 
 
 
493 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  32.83 
 
 
432 aa  72  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  26.67 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  20.96 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  32 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0508  peptidase M48, Ste24p  24.05 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  26.14 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  27.31 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  26.14 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  26.14 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  31.11 
 
 
521 aa  69.7  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  29.79 
 
 
483 aa  69.7  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  32.95 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2967  peptidase M48, Ste24p  30.81 
 
 
453 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.913599 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  31.68 
 
 
480 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  30.52 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  31.22 
 
 
589 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2972  peptidase M48 Ste24p  29.51 
 
 
447 aa  67  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.297503  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  31.22 
 
 
572 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  30.25 
 
 
288 aa  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  31.22 
 
 
560 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  31.22 
 
 
572 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  31.22 
 
 
589 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  31.91 
 
 
567 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  31.22 
 
 
589 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  28.12 
 
 
513 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  31.22 
 
 
572 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  31.22 
 
 
572 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  34.25 
 
 
343 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  32.34 
 
 
502 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  25 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  29.96 
 
 
564 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  30.97 
 
 
569 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  31.93 
 
 
561 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  30.72 
 
 
288 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  30.15 
 
 
564 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  30.16 
 
 
593 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  30.16 
 
 
588 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  30.16 
 
 
588 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>