62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1851 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1851  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 481 aa  937    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4819  transcriptional regulator PpsR  67.99 
 
 		 486 aa  630  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5286  transcriptional regulator PspR, Fis family  68.72 
 
 		 480 aa  627  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0115697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5364  transcriptional regulator, Fis family  68.3 
 
 		 479 aa  615  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.266103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3715  Fis family transcriptional regulator  65.73 
 
 		 469 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  hitchhiker  0.000579689 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2045  transcriptional regulator PspR, Fis family  45.42 
 
 		 480 aa  392  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.124174 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1718  transcriptional regulator, Fis family  45.86 
 
 		 477 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0626  Fis family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 472 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3993  Fis family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 477 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0929591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3748  transcriptional regulator PpsR  46.49 
 
 		 477 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1301  putative PAS/PAC sensor protein  43.38 
 
 		 475 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6421  Fis family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 475 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3986  Fis family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 453 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3741  transcriptional regulator PpsR  35.42 
 
 		 440 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000829732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1308  putative PAS/PAC sensor protein  35.01 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.464609 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1725  transcriptional regulator, Fis family  34.54 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.671099  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6427  transcriptional regulator PpsR2  32.89 
 
 		 456 aa  226  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3531  transcriptional regulator PpsR  31.33 
 
 		 476 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.421406 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1013  Fis family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 471 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0282  transcriptional regulator PpsR  32.16 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1925  Fis family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 464 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.178133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0164  putative PAS/PAC sensor protein  30.57 
 
 		 482 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1639  Fis family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 210 aa  99  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 1301 aa  51.6  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.49 
 
 		 1262 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2600  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.93 
 
 		 585 aa  50.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1983  sensory box protein  23.63 
 
 		 1136 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0811196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3776  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.88 
 
 		 1098 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2987  two component transcriptional regulator, Fis family  34.74 
 
 		 260 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68747e-26 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 891 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1172 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1428  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 691 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2132  bacteriophytochrome-like protein  24.37 
 
 		 727 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205555  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  20.59 
 
 		 812 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2055  transcriptional regulator  42 
 
 		 600 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000658727  hitchhiker  0.000375363 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.75 
 
 		 641 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.755089  normal  0.0153537 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.86 
 
 		 1032 aa  47.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.26 
 
 		 1148 aa  47  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 		 886 aa  47  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 		 1222 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 991 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4428  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 622 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3285  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  39.58 
 
 		 609 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1546  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.34 
 
 		 1098 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.69 
 
 		 614 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1296  two component transcriptional regulator, Fis family  39.68 
 
 		 258 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00352945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0306  hypothetical protein  36.54 
 
 		 582 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2330  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  48.98 
 
 		 466 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0918  transcriptional regulator, Fis family  41.18 
 
 		 198 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000234957  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0016  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  48.89 
 
 		 449 aa  44.3  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.420092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.03 
 
 		 1098 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1952  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  27.5 
 
 		 545 aa  44.3  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.37 
 
 		 878 aa  44.3  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3274  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 467 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0156688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2998  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 460 aa  44.3  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.605804 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1021  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.54 
 
 		 1051 aa  44.3  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1004  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.91 
 
 		 725 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0551  two component Fis family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 476 aa  43.9  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2510  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.99 
 
 		 472 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0791346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3222  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  50 
 
 		 447 aa  43.5  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0905113 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1289 aa  43.5  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  22.28 
 
 		 1258 aa  43.5  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>