36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1925 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0282  transcriptional regulator PpsR  100 
 
 		 464 aa  924    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1013  Fis family transcriptional regulator  89.85 
 
 		 471 aa  849    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1925  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 464 aa  924    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.178133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0164  putative PAS/PAC sensor protein  51.4 
 
 		 482 aa  466  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3531  transcriptional regulator PpsR  49.13 
 
 		 476 aa  460  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.421406 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4819  transcriptional regulator PpsR  32.59 
 
 		 486 aa  228  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5286  transcriptional regulator PspR, Fis family  32.37 
 
 		 480 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0115697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5364  transcriptional regulator, Fis family  32.37 
 
 		 479 aa  219  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.266103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3748  transcriptional regulator PpsR  34.23 
 
 		 477 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1301  putative PAS/PAC sensor protein  33.63 
 
 		 475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3993  Fis family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 477 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0929591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1718  transcriptional regulator, Fis family  32.18 
 
 		 477 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0626  Fis family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 472 aa  203  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3715  Fis family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 469 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  hitchhiker  0.000579689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6421  Fis family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1851  Fis family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 481 aa  193  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460761 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2045  transcriptional regulator PspR, Fis family  30.7 
 
 		 480 aa  177  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.124174 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3741  transcriptional regulator PpsR  30.28 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000829732 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3986  Fis family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1308  putative PAS/PAC sensor protein  30.17 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.464609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6427  transcriptional regulator PpsR2  30.51 
 
 		 456 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1725  transcriptional regulator, Fis family  29.69 
 
 		 464 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.671099  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1639  Fis family transcriptional regulator  61.02 
 
 		 210 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1139  putative PAS/PAC sensor protein  25.54 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3071  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.71 
 
 		 1222 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997499 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2510  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.98 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0791346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 789 aa  47.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2987  two component transcriptional regulator, Fis family  36.36 
 
 		 260 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68747e-26 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  23.4 
 
 		 1253 aa  45.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2509  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.11 
 
 		 696 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2600  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.59 
 
 		 585 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 		 974 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2055  transcriptional regulator  40 
 
 		 600 aa  44.3  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000658727  hitchhiker  0.000375363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3285  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.34 
 
 		 609 aa  43.9  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4254  putative PAS/PAC sensor protein  38.46 
 
 		 407 aa  43.9  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.157553  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01277  putative sigma-54 interacting response regulator protein  44.9 
 
 		 443 aa  43.1  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>