56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1639 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1639  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3715  Fis family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 469 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234615  hitchhiker  0.000579689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6421  Fis family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 475 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5364  transcriptional regulator, Fis family  57.14 
 
 		 479 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.266103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1851  Fis family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 481 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000460761 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5286  transcriptional regulator PspR, Fis family  55.43 
 
 		 480 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0115697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4819  transcriptional regulator PpsR  55.43 
 
 		 486 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3748  transcriptional regulator PpsR  65.75 
 
 		 477 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1301  putative PAS/PAC sensor protein  70.77 
 
 		 475 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3993  Fis family transcriptional regulator  70.77 
 
 		 477 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0929591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1718  transcriptional regulator, Fis family  70.77 
 
 		 477 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0626  Fis family transcriptional regulator  60.27 
 
 		 472 aa  95.1  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2045  transcriptional regulator PspR, Fis family  66.15 
 
 		 480 aa  91.7  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.124174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3531  transcriptional regulator PpsR  52.86 
 
 		 476 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.421406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0164  putative PAS/PAC sensor protein  58.06 
 
 		 482 aa  85.5  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0282  transcriptional regulator PpsR  61.02 
 
 		 464 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1925  Fis family transcriptional regulator  61.02 
 
 		 464 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.178133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1013  Fis family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 471 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6427  transcriptional regulator PpsR2  43.14 
 
 		 456 aa  71.6  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3986  Fis family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 453 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  0.222002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1725  transcriptional regulator, Fis family  37.76 
 
 		 464 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.671099  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3741  transcriptional regulator PpsR  45.59 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000829732 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1308  putative PAS/PAC sensor protein  35.51 
 
 		 468 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.464609 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1296  two component transcriptional regulator, Fis family  43.1 
 
 		 258 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00352945  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2998  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 460 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.605804 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2055  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 600 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000658727  hitchhiker  0.000375363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2816  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  38.46 
 
 		 591 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2600  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  42.59 
 
 		 585 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2987  two component transcriptional regulator, Fis family  42.11 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68747e-26 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03965  two-component system regulatory protein  42.37 
 
 		 448 aa  45.1  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2438  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 467 aa  45.1  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1438  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.06 
 
 		 592 aa  45.1  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2525  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  44.44 
 
 		 444 aa  44.3  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.368497  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0564  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  34.85 
 
 		 391 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2510  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.32 
 
 		 472 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0791346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3285  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.22 
 
 		 609 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1482  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.15 
 
 		 458 aa  42.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.712271  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0230  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 459 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1992  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 455 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0551  two component Fis family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 476 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.02302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4907  putative response regulator in two-component reguatory system, sigma54 dependent transcriptional regulator  40 
 
 		 452 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.412473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0286  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.18 
 
 		 488 aa  42.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.525369 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0346  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.86 
 
 		 468 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.143008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2148  helix-turn-helix, Fis-type  48.89 
 
 		 442 aa  42.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.383237 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1836  GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.86 
 
 		 601 aa  42  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0918  transcriptional regulator, Fis family  38.3 
 
 		 198 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000234957  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03680  C4 dicarboxylate two-component response regulator, sigma54-dependent; DctD2  46.67 
 
 		 461 aa  42  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0105245  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4020  hypothetical protein  29.73 
 
 		 195 aa  42  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244169 
 
 
-
 
NC_002950  PG0016  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  45.24 
 
 		 449 aa  42  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.420092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3222  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  50 
 
 		 447 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0905113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1940  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  42.55 
 
 		 455 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.525901  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3902  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  50 
 
 		 452 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0879  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.89 
 
 		 466 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3789  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  50 
 
 		 452 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.146089 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0833  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 466 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.96038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3786  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.46 
 
 		 484 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.436046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>