More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3082 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 257 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  70.69 
 
 		 238 aa  318  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  63.25 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  63.75 
 
 		 258 aa  271  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  62.15 
 
 		 253 aa  264  8.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  57.83 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  57.73 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  55.7 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  52.7 
 
 		 265 aa  224  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  54.31 
 
 		 217 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  49.82 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  52.81 
 
 		 242 aa  206  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  50.2 
 
 		 261 aa  205  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  51 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  49.8 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  55.71 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  57.07 
 
 		 197 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  49 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  51.06 
 
 		 301 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  52.73 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  50.61 
 
 		 254 aa  188  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  46.83 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  49.62 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  49.62 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  49.37 
 
 		 336 aa  185  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  54.87 
 
 		 276 aa  184  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  49.55 
 
 		 240 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  49.74 
 
 		 338 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  58.67 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  46.01 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  47.83 
 
 		 439 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  54 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  45.24 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  52.9 
 
 		 460 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  54.81 
 
 		 484 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  47.42 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  57.81 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  53.49 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  49.1 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  56.1 
 
 		 120 aa  131  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  52.8 
 
 		 210 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  44.78 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  40.3 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  39.68 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  40.83 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  46.96 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  46.55 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  42.02 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  43.48 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  41.48 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  41.1 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  46.96 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  41.53 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  41.75 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  41.13 
 
 		 202 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  43.55 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  38.14 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  40.48 
 
 		 211 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  43.59 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  41.74 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  40.74 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  40.74 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  41.53 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  40.83 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  43.59 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  48.51 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  40.17 
 
 		 191 aa  78.2  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  38.58 
 
 		 146 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  42.24 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  39.83 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  43.59 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  44.35 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  40.8 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  39.17 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4693  putative lytic transglycosylase, catalytic  40.5 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000077507  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  40.68 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  41.38 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  37.86 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1974  lytic transglycosylase, catalytic  41.27 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  41.41 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0046  Lytic transglycosylase catalytic  42.61 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  42.86 
 
 		 649 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  40.16 
 
 		 174 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 649 aa  73.9  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  40 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  42.62 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.87 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  43.1 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  41.38 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28610  lytic transglycosylase  46.23 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  42.31 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  37.25 
 
 		 215 aa  72  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0352  lytic transglycosylase  39.02 
 
 		 273 aa  72  0.000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 166 aa  72  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  36.97 
 
 		 230 aa  72  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  33.33 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  41.22 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0393  lytic transglycosylase, catalytic  39.02 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.168274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  38.4 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>