More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0029 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0029  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 276 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240678  normal  0.132165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2102  Lytic transglycosylase catalytic  62.88 
 
 		 239 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  53.71 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  64.46 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4519  lytic transglycosylase catalytic  61.98 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.821488 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  46.78 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  55.47 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  56.06 
 
 		 307 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  55.91 
 
 		 340 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  54.93 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  55.3 
 
 		 328 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  55.04 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  62.81 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  54.55 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  54.55 
 
 		 363 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  43.27 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4762  hypothetical protein  47.83 
 
 		 359 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1423  lytic transglycosylase, catalytic  46.75 
 
 		 380 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.371346  normal  0.777047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2399  lytic transglycosylase, catalytic  43.4 
 
 		 330 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.537476 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2453  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1277  Lytic transglycosylase catalytic  61.6 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1463  transglycosylase  54.61 
 
 		 262 aa  119  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  47.46 
 
 		 318 aa  115  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  57.38 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1512  lytic transglycosylase, catalytic  53.28 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.219216  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0809  lytic transglycosylase, catalytic  44.96 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1642  Lytic transglycosylase catalytic  46.34 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.517952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1459  Lytic transglycosylase catalytic  47.01 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 215 aa  99.8  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1242  lytic transglycosylase catalytic  48.41 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270703  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  42.74 
 
 		 260 aa  92.4  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  51.49 
 
 		 217 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1605  lytic murein transglycosylase  49.14 
 
 		 202 aa  91.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.914455  normal  0.613396 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  42.74 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  40.15 
 
 		 251 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  41.32 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000767564  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  39.34 
 
 		 191 aa  89  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  44.54 
 
 		 241 aa  88.6  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  39.43 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  42.54 
 
 		 231 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  46.08 
 
 		 206 aa  87  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  41.13 
 
 		 254 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  39.86 
 
 		 278 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 234 aa  85.9  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1794  putative lytic transglycosylase  40.43 
 
 		 204 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.391793  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  43.26 
 
 		 242 aa  85.5  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  42.97 
 
 		 291 aa  85.5  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  36.96 
 
 		 272 aa  85.5  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  44.35 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  43.59 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0440  lytic transglycosylase, catalytic  40.43 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  41.27 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  40.16 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  47.83 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2959  lytic transglycosylase catalytic  45.16 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0452  lytic transglycosylase, catalytic  38.93 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  45.79 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  45.54 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1584  lytic transglycosylase catalytic  35.54 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.166498  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4537  peptidase M15B and M15C DD-carboxypeptidase VanY/endolysin  51.89 
 
 		 448 aa  82  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  39.07 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  38.52 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  40.16 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6404  lytic transglycosylase catalytic  34.07 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0649822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  43.55 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  42.64 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  43.8 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  41.32 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  36.21 
 
 		 556 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  41.53 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1758  transglycosylase, SLT family  34.71 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  42.5 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  47 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  41.53 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  41.09 
 
 		 370 aa  79  0.00000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4351  lytic transglycosylase catalytic  40.83 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.744622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3617  transglycosylase, SLT family  34.71 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3535  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 1160 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1727  transglycosylase, SLT family  34.71 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000265036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1836  transglycosylase, SLT family  34.71 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  39.02 
 
 		 199 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  45.95 
 
 		 368 aa  78.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 		 638 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0050  lytic transglycosylase, catalytic  42.11 
 
 		 211 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1583  Slt family transglycosylase  34.71 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00492296  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1548  soluble lytic murein transglycosylase  34.71 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1537  soluble lytic murein transglycosylase  34.71 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000696816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1707  Slt family transglycosylase  34.71 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1886  lytic transglycosylase, catalytic  51.16 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.158781  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  42.61 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1174  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 522 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.106358 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  40.68 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  39.26 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  39.84 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  44.17 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>