99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1372 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  100 
 
 
600 aa  1213    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  32.83 
 
 
590 aa  337  3.9999999999999995e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  26.24 
 
 
659 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  25 
 
 
722 aa  134  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  25.17 
 
 
842 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.26 
 
 
699 aa  127  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  22.96 
 
 
772 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  23.99 
 
 
699 aa  123  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  25.6 
 
 
689 aa  118  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  24.4 
 
 
704 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  26.38 
 
 
695 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  25.29 
 
 
539 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  23.99 
 
 
707 aa  115  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  22.51 
 
 
569 aa  114  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  24.28 
 
 
656 aa  113  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  23.46 
 
 
596 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  25.53 
 
 
697 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  25.37 
 
 
697 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  23.1 
 
 
726 aa  104  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  26.05 
 
 
687 aa  104  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  24.33 
 
 
573 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  23.4 
 
 
574 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  23.48 
 
 
562 aa  102  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2491  hypothetical protein  23.5 
 
 
656 aa  101  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  24.17 
 
 
573 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  23.48 
 
 
562 aa  100  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  22.64 
 
 
559 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.16 
 
 
555 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  23.53 
 
 
571 aa  97.4  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  27.34 
 
 
582 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  21.53 
 
 
526 aa  92.8  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  23.05 
 
 
690 aa  91.7  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  28.29 
 
 
785 aa  91.3  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  31.22 
 
 
578 aa  89.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  22.29 
 
 
700 aa  89.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  21.58 
 
 
695 aa  88.6  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  31 
 
 
529 aa  88.2  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  21.24 
 
 
561 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  24.4 
 
 
555 aa  87.8  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  27.04 
 
 
552 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05390  hypothetical protein  27.9 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.450516  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0548  hypothetical protein  26.28 
 
 
669 aa  81.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0925063  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  30.83 
 
 
692 aa  79.7  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  26.55 
 
 
591 aa  77  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1656  hypothetical protein  29.64 
 
 
629 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.268829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  22.89 
 
 
550 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  27.93 
 
 
573 aa  74.3  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1316  protein of unknown function DUF1524 RloF  23.22 
 
 
641 aa  73.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.093517  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  20.65 
 
 
621 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  24.39 
 
 
835 aa  72.4  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  26.45 
 
 
593 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  19.9 
 
 
552 aa  71.6  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0260  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.59 
 
 
631 aa  69.3  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0469  protein of unknown function DUF262  26.45 
 
 
609 aa  67.4  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  28.87 
 
 
585 aa  67.4  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  27.47 
 
 
619 aa  66.6  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  27.89 
 
 
584 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  27.89 
 
 
584 aa  66.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  24.26 
 
 
465 aa  65.1  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  24.26 
 
 
465 aa  65.1  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  24.03 
 
 
689 aa  63.9  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4567  hypothetical protein  25.62 
 
 
223 aa  63.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  27.46 
 
 
606 aa  62  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  25.78 
 
 
573 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  22.19 
 
 
568 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  26.82 
 
 
593 aa  59.3  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  24.1 
 
 
723 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3189  hypothetical protein  25.09 
 
 
564 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.362405  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  24.17 
 
 
588 aa  55.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  34.09 
 
 
172 aa  54.3  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  32.29 
 
 
619 aa  54.3  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  27.09 
 
 
646 aa  53.9  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1071  hypothetical protein  23.26 
 
 
490 aa  53.5  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0823  hypothetical protein  28.71 
 
 
201 aa  53.5  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000716411  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4610  hypothetical protein  22.35 
 
 
656 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60707  hitchhiker  0.000289405 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  26.42 
 
 
458 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0950  hypothetical protein  26.77 
 
 
491 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  35.96 
 
 
649 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  24.27 
 
 
600 aa  52  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00127  hypothetical protein  36.84 
 
 
722 aa  52  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  26 
 
 
680 aa  52.4  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1183  hypothetical protein  33.63 
 
 
779 aa  51.6  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00761899  normal  0.154404 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0174  hypothetical protein  33.63 
 
 
779 aa  51.6  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00791399  hitchhiker  0.00018824 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  25.66 
 
 
563 aa  52  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  41.49 
 
 
499 aa  50.4  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  28.78 
 
 
580 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2088  hypothetical protein  28.16 
 
 
780 aa  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.346765  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0564  hypothetical protein  24.29 
 
 
504 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.755546  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0038  hypothetical protein  29.73 
 
 
696 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  21.83 
 
 
709 aa  47  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  24.7 
 
 
498 aa  46.6  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  23.4 
 
 
663 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  21.74 
 
 
598 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  23.02 
 
 
664 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  23.59 
 
 
617 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  25 
 
 
615 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0248  hypothetical protein  31.58 
 
 
615 aa  44.3  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  23.75 
 
 
582 aa  43.9  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  34.67 
 
 
470 aa  43.9  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>