17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0564 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0564  hypothetical protein  100 
 
 		 504 aa  1045    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.755546  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3189  hypothetical protein  60.08 
 
 		 564 aa  660    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.362405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  32.41 
 
 		 588 aa  232  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  22.1 
 
 		 619 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  22.85 
 
 		 574 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  28.57 
 
 		 590 aa  53.9  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  25.41 
 
 		 580 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  20.58 
 
 		 571 aa  50.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  24.51 
 
 		 573 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  24.29 
 
 		 600 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  19.89 
 
 		 584 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  19.78 
 
 		 584 aa  47.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  19.82 
 
 		 726 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  23.26 
 
 		 555 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  22.02 
 
 		 569 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  22.57 
 
 		 562 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  21.56 
 
 		 552 aa  44.3  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>