More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0331 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
377 aa  746    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  93.65 
 
 
378 aa  708    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  66.86 
 
 
376 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_003296  RS01985  amino acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  48.45 
 
 
386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3793  Extracellular ligand-binding receptor  49.59 
 
 
386 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.15379 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3906  Extracellular ligand-binding receptor  49.59 
 
 
386 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1651  Extracellular ligand-binding receptor  45.75 
 
 
392 aa  282  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.689603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5603  Extracellular ligand-binding receptor  40.64 
 
 
393 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.442467  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1211  Extracellular ligand-binding receptor  40.51 
 
 
390 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.391251  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  35.67 
 
 
399 aa  193  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  37.39 
 
 
398 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  36.03 
 
 
394 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0465  extracellular ligand-binding receptor  35.76 
 
 
416 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0898027  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0717  Extracellular ligand-binding receptor  34.88 
 
 
413 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726528  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0718  Extracellular ligand-binding receptor  35.4 
 
 
412 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  31.51 
 
 
374 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  35.36 
 
 
376 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  33.52 
 
 
396 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.31 
 
 
399 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  34.2 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.83 
 
 
399 aa  173  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  32.38 
 
 
396 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0735  extracellular ligand-binding receptor  37.81 
 
 
385 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  32.58 
 
 
384 aa  170  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2535  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.64 
 
 
397 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  32.29 
 
 
395 aa  169  6e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  31.64 
 
 
397 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 
404 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  32 
 
 
397 aa  169  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
404 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  31.37 
 
 
397 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  31.37 
 
 
397 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5102  extracellular ligand-binding receptor  32.17 
 
 
397 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.294794 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  33.62 
 
 
376 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1166  Extracellular ligand-binding receptor  31.92 
 
 
387 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428965 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  32.51 
 
 
381 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  32.2 
 
 
405 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0714  Extracellular ligand-binding receptor  32.73 
 
 
395 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 
402 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  30.36 
 
 
419 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.16 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 
385 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  32.41 
 
 
384 aa  151  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1891  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic protein  31.36 
 
 
395 aa  150  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  31.02 
 
 
393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  32.34 
 
 
379 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2022  Extracellular ligand-binding receptor  29.92 
 
 
373 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.882154  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  29.14 
 
 
375 aa  145  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  29.52 
 
 
379 aa  143  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  31.01 
 
 
392 aa  142  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  30.49 
 
 
380 aa  142  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  32.54 
 
 
382 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  31.62 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  32.71 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  29.35 
 
 
389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  30.11 
 
 
387 aa  140  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  29.6 
 
 
383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2496  branched-chain amino-acid ABC transport system periplasmic binding protein  29.97 
 
 
399 aa  139  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.106087  hitchhiker  0.00162568 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.58 
 
 
378 aa  138  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  31.92 
 
 
385 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  30.65 
 
 
386 aa  138  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  32.2 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  29.71 
 
 
390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 
396 aa  135  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  29.78 
 
 
393 aa  135  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  30.16 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  33.14 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 
380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  29.31 
 
 
381 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 
386 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.32 
 
 
380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 
397 aa  133  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  30.11 
 
 
388 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  31.16 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  32.47 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  30.05 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  30.56 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  31.44 
 
 
391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  30.61 
 
 
390 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  30.12 
 
 
370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  28.18 
 
 
379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  31.82 
 
 
379 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1131  extracellular ligand-binding receptor  26.91 
 
 
389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  29.71 
 
 
369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  31.16 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.88 
 
 
380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  30.68 
 
 
379 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  31.82 
 
 
396 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  30.88 
 
 
384 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  31.15 
 
 
397 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 
402 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1290  branched chain amino acid ABC transporter permease  28.61 
 
 
392 aa  126  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.169952  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  31.16 
 
 
380 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0533  Extracellular ligand-binding receptor  28.8 
 
 
393 aa  126  6e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  28.97 
 
 
392 aa  126  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.75 
 
 
385 aa  126  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  31.16 
 
 
380 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  30.7 
 
 
397 aa  126  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>