99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2212 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  100 
 
 		 394 aa  807    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  29.41 
 
 		 406 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  26.47 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  28.69 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  30.93 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  24.05 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  24.13 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  24.48 
 
 		 379 aa  102  9e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  23.76 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  25.69 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  27.16 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  25.31 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  27.01 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  23.85 
 
 		 429 aa  93.2  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  25.41 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  28.11 
 
 		 415 aa  91.3  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  25.41 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  22.37 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  26.4 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  23.51 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  23.02 
 
 		 423 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  26.67 
 
 		 409 aa  88.2  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  26.39 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  24.05 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  26.89 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  25.47 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  23.79 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  22.83 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  26.09 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  28.65 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  22.14 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  26.51 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  25 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  24.69 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  21.64 
 
 		 423 aa  79.3  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  22.83 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  21.18 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  23.59 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  28.64 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  28.29 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  23.37 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  21.14 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  24.94 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  34.27 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  21.95 
 
 		 400 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  27.18 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  28.19 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  22.6 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  25.1 
 
 		 487 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  23.81 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  26.18 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  25.4 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  25.73 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  22.67 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  28.48 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  21.07 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  21.62 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  26.51 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  23.26 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  29.08 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  24.61 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  25.65 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  23.98 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  26.99 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  23.38 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  24.36 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  28.57 
 
 		 460 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  27.93 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  26.34 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  23.42 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  23.79 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  24.01 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  30.26 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  24.41 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  22.63 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  29.77 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  25.18 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  23.26 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  24.62 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  27.98 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  25.9 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  24 
 
 		 399 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  21.33 
 
 		 419 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  28.99 
 
 		 389 aa  53.9  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  22.97 
 
 		 378 aa  53.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  22.62 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  23.67 
 
 		 403 aa  50.8  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3190  diguanylate cyclase  31.9 
 
 		 852 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  23.78 
 
 		 445 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  23.58 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  22.98 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2044  putative signal transduction protein  22.99 
 
 		 398 aa  46.6  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4432  putative signal transduction protein  26.62 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  21.83 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 283 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  25 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  25 
 
 		 403 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  29.25 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>