122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2629 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
338 aa  664  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  49.53 
 
 
338 aa  305  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  47.83 
 
 
341 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  48.14 
 
 
341 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  47.83 
 
 
345 aa  296  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  44.22 
 
 
345 aa  283  4e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  45.96 
 
 
341 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.9767e-06  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  44.69 
 
 
341 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  46.75 
 
 
341 aa  274  1e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  44.06 
 
 
341 aa  272  5e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  41.6 
 
 
352 aa  263  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.03 
 
 
389 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  42.33 
 
 
383 aa  255  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  42.82 
 
 
341 aa  252  7e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.39 
 
 
393 aa  235  8e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  37.71 
 
 
350 aa  230  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  34.96 
 
 
343 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  35.36 
 
 
345 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  35.36 
 
 
345 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  35.2 
 
 
365 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  41.03 
 
 
403 aa  207  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  38.62 
 
 
394 aa  203  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  37.15 
 
 
349 aa  201  1e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  37.78 
 
 
408 aa  197  2e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  33.52 
 
 
367 aa  197  2e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  30.75 
 
 
374 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  32.16 
 
 
374 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.43599e-05 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  35.33 
 
 
360 aa  196  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  31.62 
 
 
374 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  33.24 
 
 
376 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35775e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  31.35 
 
 
374 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  32.97 
 
 
376 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  31.34 
 
 
368 aa  192  8e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  32.97 
 
 
376 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  32.97 
 
 
376 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  32.77 
 
 
362 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  31.44 
 
 
378 aa  190  3e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  32.87 
 
 
369 aa  189  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  34.16 
 
 
426 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  35.82 
 
 
417 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  37.72 
 
 
405 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  35.45 
 
 
420 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  33.24 
 
 
346 aa  186  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  34.16 
 
 
419 aa  185  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  36.47 
 
 
401 aa  184  1e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  36.01 
 
 
430 aa  182  5e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  31.72 
 
 
377 aa  182  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  30.47 
 
 
369 aa  180  3e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  35.59 
 
 
409 aa  179  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  34.42 
 
 
349 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  34.42 
 
 
349 aa  178  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  36.64 
 
 
364 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  37.2 
 
 
395 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  30.79 
 
 
361 aa  176  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  31.12 
 
 
377 aa  176  5e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  36.5 
 
 
390 aa  175  1e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  36.42 
 
 
388 aa  174  1e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  34.65 
 
 
387 aa  173  4e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 
358 aa  172  7e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  29.78 
 
 
353 aa  162  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  30.36 
 
 
364 aa  156  5e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  28.99 
 
 
364 aa  153  3e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  29.33 
 
 
366 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  30.18 
 
 
391 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  30.48 
 
 
367 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  29.18 
 
 
377 aa  137  3e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  30.37 
 
 
333 aa  133  4e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.0411e-06  hitchhiker  3.23717e-12 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  28.09 
 
 
384 aa  127  4e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  27.32 
 
 
384 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  28.95 
 
 
340 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.7016e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  28.74 
 
 
331 aa  121  2e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  28.71 
 
 
339 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  29.21 
 
 
335 aa  119  1e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  30.46 
 
 
440 aa  117  4e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  30.46 
 
 
440 aa  116  7e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  27.02 
 
 
359 aa  115  1e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  30.61 
 
 
435 aa  115  1e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  29.23 
 
 
440 aa  114  2e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  28.21 
 
 
333 aa  111  2e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.22112e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2866  hypothetical protein  34.4 
 
 
329 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  30.28 
 
 
338 aa  106  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.97 
 
 
429 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  30.2 
 
 
394 aa  97.1  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.01658e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  27.05 
 
 
335 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1944  LysM domain/BON superfamily protein  41.82 
 
 
161 aa  49.3  9e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123188  normal  0.0308749 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  25.79 
 
 
203 aa  49.3  9e-05  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2267  LysM domain/BON superfamily protein  41.82 
 
 
161 aa  49.3  9e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0461572  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2244  hypothetical protein  50 
 
 
156 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0662  putative cell wall turnover protein  40 
 
 
185 aa  47  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2281  LysM domain-containing protein  37.5 
 
 
357 aa  47  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0169093  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  42 
 
 
143 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  42.19 
 
 
377 aa  46.2  0.0007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  40.62 
 
 
428 aa  46.2  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2915  Peptidoglycan-binding LysM  41.07 
 
 
566 aa  46.2  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1297  transport-associated protein  40 
 
 
156 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.451371  normal  0.073309 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  39.58 
 
 
158 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  47.27 
 
 
1051 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  38.81 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0549  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
162 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0533  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
162 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.235675  normal  0.091629 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>