97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2274 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 		 389 aa  783    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  50.26 
 
 		 383 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  43.9 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  43.03 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  41.64 
 
 		 345 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  42.15 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  43.34 
 
 		 345 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  42.15 
 
 		 341 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  39.53 
 
 		 352 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  40.37 
 
 		 341 aa  236  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  40.43 
 
 		 341 aa  231  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  38.07 
 
 		 341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  37.76 
 
 		 341 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  34.24 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  35.48 
 
 		 426 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.74 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  35.36 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  35.22 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  35.24 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  37.17 
 
 		 405 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  31.59 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  32.55 
 
 		 403 aa  189  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  31.3 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  32.59 
 
 		 420 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  30.72 
 
 		 374 aa  186  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  35.41 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  30.43 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  32.46 
 
 		 387 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  29.28 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  32.84 
 
 		 390 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  34.08 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  35.61 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  31.18 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  35.6 
 
 		 349 aa  180  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  29.5 
 
 		 365 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  35.31 
 
 		 345 aa  179  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  32.63 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  32.63 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  33.61 
 
 		 408 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  34.34 
 
 		 409 aa  176  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  32.54 
 
 		 367 aa  175  9e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  31.88 
 
 		 346 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  30.7 
 
 		 368 aa  172  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  30.46 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  30.46 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  30.46 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  31.4 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  30.46 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  30.52 
 
 		 362 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  31.1 
 
 		 430 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  32.88 
 
 		 377 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  30.32 
 
 		 358 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  31.4 
 
 		 369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  30.03 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  31.7 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  31.7 
 
 		 377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  29.85 
 
 		 391 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  30.55 
 
 		 388 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  28.19 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  32.23 
 
 		 366 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  30.26 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  30.12 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  30.12 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  28.36 
 
 		 353 aa  150  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  29.61 
 
 		 364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  27.11 
 
 		 364 aa  139  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  29.91 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  30.81 
 
 		 435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  30.94 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  30.41 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  30.09 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  30.7 
 
 		 440 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  28.69 
 
 		 384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  27.27 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  26.81 
 
 		 331 aa  120  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.17 
 
 		 429 aa  119  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  28.66 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  27.6 
 
 		 333 aa  116  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  27.83 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  25.16 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  28.98 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  29.02 
 
 		 335 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2866  hypothetical protein  30.24 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  27.16 
 
 		 338 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  41.67 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  39.44 
 
 		 935 aa  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3277  lysM domain-containing protein  30.23 
 
 		 235 aa  46.6  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  37.68 
 
 		 219 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4651  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  33.33 
 
 		 1124 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.839576 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2281  LysM domain-containing protein  39.58 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0169093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8593  Peptidoglycan-binding LysM  43.64 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902374  normal  0.799796 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  43.14 
 
 		 205 aa  44.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0721  peptidoglycan-binding LysM  39.06 
 
 		 572 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.467953 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.43 
 
 		 391 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  51.06 
 
 		 307 aa  43.5  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0431  peptidoglycan-binding LysM  32.43 
 
 		 543 aa  43.1  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000410197  normal  0.723763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>