88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00180 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  100 
 
 		 341 aa  680    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  72.46 
 
 		 345 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  71.85 
 
 		 341 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  70.67 
 
 		 341 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  67.16 
 
 		 341 aa  474  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019767  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  68.62 
 
 		 341 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  68.04 
 
 		 341 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  49.44 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  51.38 
 
 		 338 aa  335  5e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  44.09 
 
 		 345 aa  277  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  46.75 
 
 		 338 aa  275  8e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  43.29 
 
 		 383 aa  262  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  40.43 
 
 		 389 aa  232  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  39.49 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  37.96 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  41.59 
 
 		 341 aa  229  4e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  39.49 
 
 		 345 aa  228  8e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  34.71 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  35.33 
 
 		 378 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  35.05 
 
 		 374 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  34.78 
 
 		 374 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000243599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  34.78 
 
 		 374 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  38.42 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  40.97 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  34.79 
 
 		 376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  34.79 
 
 		 376 aa  215  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  34.79 
 
 		 376 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  34.79 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  37.1 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  34.1 
 
 		 393 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  34.53 
 
 		 367 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  37.02 
 
 		 369 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  34.25 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  39.43 
 
 		 405 aa  208  9e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  38.14 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  38.48 
 
 		 394 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  35.1 
 
 		 403 aa  207  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  35.69 
 
 		 426 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  35.19 
 
 		 343 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  35.69 
 
 		 419 aa  204  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  38.24 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  41.61 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  37.24 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  35.08 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  35.48 
 
 		 369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  38.8 
 
 		 409 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  39.32 
 
 		 420 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  35.11 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  32.75 
 
 		 377 aa  192  7e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  33.24 
 
 		 360 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  32.18 
 
 		 377 aa  188  1e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  32.94 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  37.54 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  37.24 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  36.94 
 
 		 364 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  31.12 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  31.12 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  37.58 
 
 		 358 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  31.25 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  32.81 
 
 		 377 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  29.07 
 
 		 361 aa  165  9e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  33.23 
 
 		 391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  31.36 
 
 		 364 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  30.42 
 
 		 353 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  31.18 
 
 		 364 aa  146  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  31.12 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  29.67 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  28.64 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2866  hypothetical protein  37.15 
 
 		 329 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  28.62 
 
 		 333 aa  123  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  26.46 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  26.57 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  28.08 
 
 		 440 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  27.62 
 
 		 359 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  25.84 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  26.32 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  29.57 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  27.56 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  27.99 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  26.32 
 
 		 335 aa  96.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  28.87 
 
 		 335 aa  95.9  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  24.12 
 
 		 333 aa  95.9  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25.95 
 
 		 429 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  24.86 
 
 		 340 aa  93.6  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0326  LysM domain protein  39.53 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0219877  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  35.06 
 
 		 158 aa  43.1  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  42.11 
 
 		 219 aa  42.7  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1755  peptidoglycan-binding LysM  42 
 
 		 195 aa  42.7  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.273127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>