74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2866 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2866  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  36.19 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  34.92 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  37.15 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  34.92 
 
 		 341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  34.68 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  32.53 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  37.2 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  31.27 
 
 		 341 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000019767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  32.09 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  29.96 
 
 		 352 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  34.4 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  31.92 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  30.59 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  29.18 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  32 
 
 		 383 aa  99.8  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  33.07 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  33.2 
 
 		 358 aa  96.3  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  31.37 
 
 		 395 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  28.57 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  30.37 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  31.37 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  30.4 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  30 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.24 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  30.8 
 
 		 390 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  33.59 
 
 		 388 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  29.51 
 
 		 419 aa  90.9  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25.4 
 
 		 393 aa  89.7  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  29.18 
 
 		 426 aa  89.4  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  32.52 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  31.33 
 
 		 420 aa  86.3  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  30.85 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  30.92 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  29.29 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  29.32 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  29.32 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  28.99 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  29.48 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  29.13 
 
 		 430 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  27.84 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  26.52 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  29.23 
 
 		 403 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  29.64 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  27.31 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  24.29 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  25.71 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  26.27 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  26.67 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  25.09 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  25.8 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  26.67 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  24 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000030411  hitchhiker  0.00000000000323717 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  24.54 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  25.35 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000322112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  23.04 
 
 		 340 aa  55.8  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027016  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  26.02 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  26.91 
 
 		 429 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  24.12 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  22.91 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  22.26 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  27.21 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  23.5 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  22.17 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  22.17 
 
 		 376 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  22.17 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235775 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  22.17 
 
 		 376 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  27.09 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  25.17 
 
 		 338 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  25.5 
 
 		 335 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  25.23 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  23.63 
 
 		 360 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  24.2 
 
 		 440 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>