236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0067 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0067  thymidine phosphorylase  100 
 
 		 505 aa  1011    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000469248 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0551  thymidine phosphorylase  61.19 
 
 		 507 aa  617  1e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000734459  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0523  thymidine phosphorylase  62.38 
 
 		 508 aa  610  1e-173  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.205816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2125  thymidine phosphorylase  59.56 
 
 		 509 aa  593  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2262  thymidine phosphorylase  56.83 
 
 		 516 aa  580  1e-164  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0255  thymidine phosphorylase  53.77 
 
 		 506 aa  519  1e-146  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.456015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3188  thymidine phosphorylase  53.85 
 
 		 506 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0024826 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0462  thymidine phosphorylase  53.77 
 
 		 512 aa  512  1e-144  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0332  thymidine phosphorylase  46.44 
 
 		 506 aa  413  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0618  thymidine phosphorylase  43.6 
 
 		 504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1338  thymidine phosphorylase  43.35 
 
 		 505 aa  402  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.620213  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0624  thymidine phosphorylase  42.94 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.751254  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1346  thymidine phosphorylase  42.74 
 
 		 505 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1329  thymidine phosphorylase  42.94 
 
 		 505 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.237717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0093  putative thymidine phosphorylase  40.57 
 
 		 520 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.543018  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4015  thymidine phosphorylase  39.21 
 
 		 492 aa  317  3e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2359  thymidine phosphorylase  38.41 
 
 		 517 aa  315  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3541  thymidine phosphorylase  40.1 
 
 		 526 aa  297  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1194  thymidine phosphorylase  39.81 
 
 		 511 aa  286  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1717  thymidine phosphorylase  38.33 
 
 		 516 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.124603  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2241  thymidine phosphorylase  39.95 
 
 		 522 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0807352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3880  thymidine phosphorylase  36.93 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1900  thymidine phosphorylase  40.72 
 
 		 530 aa  278  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4625  thymidine phosphorylase  40.75 
 
 		 514 aa  276  7e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2473  thymidine phosphorylase  37.92 
 
 		 514 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1507  thymidine phosphorylase  35.59 
 
 		 511 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3581  thymidine phosphorylase  37.7 
 
 		 495 aa  273  8.000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2497  thymidine phosphorylase  38.19 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000364151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1443  thymidine phosphorylase  39.43 
 
 		 514 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0271925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3062  thymidine phosphorylase  39.07 
 
 		 485 aa  269  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3461  thymidine phosphorylase  35.21 
 
 		 505 aa  267  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592088 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2690  thymidine phosphorylase  36.3 
 
 		 513 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.44946 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4089  thymidine phosphorylase  38.85 
 
 		 513 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0836613 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5323  thymidine phosphorylase  35.51 
 
 		 504 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1709  thymidine phosphorylase  35.51 
 
 		 504 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4378  thymidine phosphorylase  36.17 
 
 		 518 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4510  thymidine phosphorylase  36.17 
 
 		 518 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00125183  normal  0.427324 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4704  thymidine phosphorylase  36.97 
 
 		 512 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0864687  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0204  thymidine phosphorylase  35.23 
 
 		 507 aa  247  4e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.61192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0191  thymidine phosphorylase  34.61 
 
 		 519 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3746  thymidine phosphorylase  37.22 
 
 		 450 aa  226  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3234  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.1 
 
 		 431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08120  thymidine phosphorylase  33.5 
 
 		 433 aa  193  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.80887  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4730  thymidine phosphorylase  32.52 
 
 		 433 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25710  thymidine phosphorylase  33.33 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4842  thymidine phosphorylase  32.48 
 
 		 443 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2275  thymidine phosphorylase  31.72 
 
 		 435 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000178657  hitchhiker  0.000000323962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5934  thymidine phosphorylase  31.71 
 
 		 444 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0130951 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2180  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.73 
 
 		 435 aa  183  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.571226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0787  thymidine phosphorylase  31.22 
 
 		 429 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1142  thymidine phosphorylase  32.28 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.698076  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1232  thymidine phosphorylase  32.72 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1249  thymidine phosphorylase  32.72 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0959988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1215  thymidine phosphorylase  32.05 
 
 		 443 aa  181  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000539787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1591  thymidine phosphorylase  31.44 
 
 		 433 aa  181  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.038951  normal  0.387396 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0829  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  32.28 
 
 		 431 aa  180  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.829074  normal  0.764393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13345  thymidine phosphorylase  30.86 
 
 		 427 aa  179  9e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.194332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0969  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.17 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.880368  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1258  thymidine phosphorylase  32.55 
 
 		 439 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1357  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  33.91 
 
 		 424 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0999  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.54 
 
 		 432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.182708  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2940  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.52 
 
 		 431 aa  173  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0974765  hitchhiker  0.00313698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6449  thymidine phosphorylase  31.67 
 
 		 424 aa  173  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0075  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.65 
 
 		 446 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3535  thymidine phosphorylase  29.95 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00606286  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1780  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.22 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.187256  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0682  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.66 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.390934 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1138  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.31 
 
 		 434 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000122674  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0147  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.3 
 
 		 441 aa  167  5e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3447  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.6 
 
 		 430 aa  167  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1274  Thymidine phosphorylase  30.38 
 
 		 426 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0756  thymidine phosphorylase  30.51 
 
 		 426 aa  166  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05440  thymidine phosphorylase  28.86 
 
 		 438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.881323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1176  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.07 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.246422  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0409  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.08 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0113  thymidine phosphorylase  30.45 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000787887  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1318  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.9 
 
 		 433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf238  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.7 
 
 		 431 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.01595  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0812  thymidine phosphorylase  29.59 
 
 		 426 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.376923 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1025  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.67 
 
 		 431 aa  163  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1775  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.74 
 
 		 441 aa  163  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4398  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.32 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21230  thymidine phosphorylase  30.5 
 
 		 437 aa  162  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04940  thymidine phosphorylase  30.7 
 
 		 444 aa  161  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2054  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  31.21 
 
 		 438 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3944  thymidine phosphorylase  30.24 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  hitchhiker  0.00269501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4189  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.57 
 
 		 424 aa  159  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1665  thymidine phosphorylase  28.7 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.477565  normal  0.134735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2567  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.23 
 
 		 461 aa  157  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0678  thymidine phosphorylase  31.37 
 
 		 433 aa  157  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1750  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.15 
 
 		 440 aa  157  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1471  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  29.69 
 
 		 434 aa  156  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.606282  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1488  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  27.49 
 
 		 434 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.023549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4154  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.12 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00147082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2784  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.54 
 
 		 434 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4218  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.12 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000180142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3826  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.12 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000962839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3842  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.12 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00792291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4109  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.12 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.99872e-53 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3995  pyrimidine-nucleoside phosphorylase  30.12 
 
 		 434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>