More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3208 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  73.66 
 
 		 226 aa  333  9e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  73.66 
 
 		 226 aa  331  6e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  73.09 
 
 		 250 aa  325  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  74.31 
 
 		 219 aa  325  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4380  hypothetical protein  76.28 
 
 		 219 aa  324  8.000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4249  alanine racemase domain protein  74.77 
 
 		 219 aa  322  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.405464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3923  alanine racemase domain protein  72.94 
 
 		 219 aa  317  7.999999999999999e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823584  normal  0.338994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  65.75 
 
 		 232 aa  288  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0174  hypothetical protein  66.2 
 
 		 228 aa  285  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.913317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  63.51 
 
 		 224 aa  284  8e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0383  hypothetical protein  64.19 
 
 		 221 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  62.27 
 
 		 219 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  66.2 
 
 		 230 aa  276  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0438  hypothetical protein  63.26 
 
 		 221 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0096  hypothetical protein  61.75 
 
 		 225 aa  272  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480165  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  56.42 
 
 		 226 aa  265  5.999999999999999e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0288  alanine racemase domain protein  62.07 
 
 		 219 aa  264  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  63.13 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0226  alanine racemase domain-containing protein  60 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0695521  normal  0.167093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  56.31 
 
 		 250 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  59.52 
 
 		 227 aa  260  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3634  hypothetical protein  57.34 
 
 		 242 aa  259  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  55.86 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  57.08 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  55.41 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1285  alanine racemase domain-containing protein  62.37 
 
 		 230 aa  251  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0048  hypothetical protein  56.42 
 
 		 218 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  56.74 
 
 		 217 aa  238  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2952  hypothetical protein  59 
 
 		 225 aa  237  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  54.59 
 
 		 220 aa  234  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5034  alanine racemase domain-containing protein  62.5 
 
 		 214 aa  234  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0042  alanine racemase domain protein  55.76 
 
 		 218 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221923 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0414  hypothetical protein  54.93 
 
 		 217 aa  231  9e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  53.02 
 
 		 226 aa  230  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0844  hypothetical protein  55.56 
 
 		 221 aa  223  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0415  alanine racemase domain protein  47.83 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.837437  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  55.09 
 
 		 221 aa  221  7e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3024  hypothetical protein  54.55 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  51.82 
 
 		 221 aa  215  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0433  hypothetical protein  55.73 
 
 		 191 aa  212  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0628  alanine racemase domain protein  54.08 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0643141 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2054  alanine racemase domain-containing protein  54.93 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0733965  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  45.37 
 
 		 231 aa  176  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2164  alanine racemase domain protein  39.81 
 
 		 219 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  40.69 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  43.1 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1137  alanine racemase domain-containing protein  41.13 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.218353  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  47.21 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  39.83 
 
 		 232 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  39.66 
 
 		 232 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  38.6 
 
 		 228 aa  157  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  43.36 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4142  alanine racemase domain-containing protein  40.44 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  41.41 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  39.22 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  39.22 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  43.23 
 
 		 230 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  39.66 
 
 		 234 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  41.56 
 
 		 232 aa  154  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  39.22 
 
 		 232 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  38.63 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  42.79 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6110  alanine racemase domain protein  38.94 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  37.93 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  42.24 
 
 		 232 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  38.36 
 
 		 238 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  39.22 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  39.06 
 
 		 236 aa  151  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  39.22 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  39.22 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  39.22 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  44.27 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  41.13 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  40.69 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02781  predicted enzyme  39.22 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.121558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0744  alanine racemase domain protein  39.22 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3093  alanine racemase  39.22 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310002 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0763  alanine racemase domain-containing protein  39.22 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.265197  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1288  hypothetical protein  42.42 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3111  alanine racemase  39.22 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  38.63 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4254  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  39.22 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.499723  normal  0.581588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3383  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  39.22 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02744  hypothetical protein  39.22 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108166  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1194  hypothetical protein  37.83 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0326541  normal  0.680899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3295  alanine racemase  39.22 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  44.27 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  37.39 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  37.93 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3357  alanine racemase domain-containing protein  41.81 
 
 		 233 aa  148  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00164594 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  38.6 
 
 		 234 aa  148  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  37.61 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  40.6 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2315  hypothetical protein  38.33 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000951598  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  41.05 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  41.48 
 
 		 238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  40.71 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0775  alanine racemase domain protein  38.86 
 
 		 241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3718  hypothetical protein  38.16 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>