92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1191 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  367  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  34.76 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  39.61 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  33.12 
 
 		 170 aa  78.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  40.8 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  34.75 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  38.1 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  31.76 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  32.32 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  30 
 
 		 390 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  32.94 
 
 		 175 aa  61.2  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  38.26 
 
 		 283 aa  60.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  28.47 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  31.76 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  32.1 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  33.13 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  30.43 
 
 		 270 aa  52.4  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0254  zinc-dependent metallopeptidase  35.58 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2705  protein of unknown function DUF955  31.25 
 
 		 186 aa  51.2  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000214852  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  30.28 
 
 		 257 aa  51.2  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 410 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  35.78 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  28.08 
 
 		 1177 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B25  hypothetical protein  26.09 
 
 		 231 aa  49.7  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.548873  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  32.76 
 
 		 366 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2224  protein of unknown function DUF955  31.97 
 
 		 399 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000122328  unclonable  0.000000000370902 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0986  neutral zinc metallopeptidase  36.63 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000837307  unclonable  0.00000139166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1546  hypothetical protein  28.77 
 
 		 277 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  0.799825 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1909  hypothetical protein  32.23 
 
 		 376 aa  48.5  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000017114  decreased coverage  0.00513377 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2058  protein of unknown function DUF955  29.55 
 
 		 227 aa  48.5  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000868136  normal  0.0120783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  31.35 
 
 		 378 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1586  protein of unknown function DUF955  34.07 
 
 		 129 aa  48.1  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.764217  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  28.47 
 
 		 221 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3472  hypothetical protein  28.93 
 
 		 355 aa  48.5  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645952  unclonable  0.000000776593 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  30 
 
 		 261 aa  48.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  28.4 
 
 		 271 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  28.4 
 
 		 271 aa  47.8  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  30.63 
 
 		 292 aa  47.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  28.24 
 
 		 307 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  31.96 
 
 		 295 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  34.62 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  31.96 
 
 		 295 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  34.91 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2309  hypothetical protein  29.84 
 
 		 241 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.316951 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  31.96 
 
 		 295 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4066  hypothetical protein  36.59 
 
 		 336 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.621237 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3460  hypothetical protein  25.49 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0627917  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3830  prophage LambdaBa01, repressor protein  25.49 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3546  prophage LambdaBa01, repressor protein  25.49 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0062  hypothetical protein  30.21 
 
 		 394 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0277  hypothetical protein  26.63 
 
 		 248 aa  45.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000415699  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  30.28 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  26.92 
 
 		 251 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  34.23 
 
 		 269 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  27.91 
 
 		 302 aa  45.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  29.3 
 
 		 289 aa  45.1  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4792  hypothetical protein  28.81 
 
 		 395 aa  45.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  28.21 
 
 		 355 aa  44.7  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  27.52 
 
 		 296 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  27.35 
 
 		 350 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1063  protein of unknown function DUF955  33.33 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0896525  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  34.07 
 
 		 435 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 346 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  34.07 
 
 		 435 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  24.6 
 
 		 362 aa  44.3  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  41.43 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1746  hypothetical protein  26.95 
 
 		 262 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113696  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  40.62 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  31.25 
 
 		 393 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2659  hypothetical protein  28.65 
 
 		 425 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00418802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  40.62 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  29.79 
 
 		 1180 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  32 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  25.78 
 
 		 294 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0468  helix-turn-helix domain protein  26.49 
 
 		 426 aa  42.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592204 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0509  hypothetical protein  51.16 
 
 		 107 aa  42.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2566  hypothetical protein  29.31 
 
 		 285 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  30.97 
 
 		 269 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 400 aa  42  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3466  hypothetical protein  25.98 
 
 		 142 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6153  protein of unknown function DUF955  24 
 
 		 359 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  30.43 
 
 		 286 aa  42  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  29.09 
 
 		 266 aa  41.6  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  39.19 
 
 		 302 aa  41.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  28.57 
 
 		 386 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  30.43 
 
 		 294 aa  41.2  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3665  hypothetical protein  27.93 
 
 		 372 aa  41.2  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00323542  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  27.78 
 
 		 291 aa  41.2  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1331  protein of unknown function DUF955  25.87 
 
 		 401 aa  40.8  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  unclonable  0.000000000196734  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3955  hypothetical protein  31 
 
 		 400 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  30.51 
 
 		 342 aa  40.8  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 367 aa  40.8  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>