More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0661 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  395  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  68.39 
 
 		 192 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  64.77 
 
 		 192 aa  262  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  64.25 
 
 		 192 aa  261  4.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  64.77 
 
 		 192 aa  260  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  62.56 
 
 		 192 aa  251  6e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  53.37 
 
 		 192 aa  204  5e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  46.32 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  44.04 
 
 		 192 aa  168  5e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0402  transcriptional regulator, XRE family  46.84 
 
 		 189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699228  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  46.11 
 
 		 188 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  44.56 
 
 		 191 aa  158  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  44.68 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 189 aa  154  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  42.05 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  35.45 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  35.98 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  32.98 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 187 aa  92  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.98 
 
 		 189 aa  92  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  29.47 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0587  cupin 2 domain-containing protein  32.29 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 180 aa  89  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 180 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 191 aa  87.8  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 187 aa  87.8  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1110  Phosphate butyryltransferase  25.68 
 
 		 503 aa  87.8  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  27.57 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  27.57 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  31.15 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  31.72 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  31.77 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  30.9 
 
 		 184 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.63 
 
 		 503 aa  85.1  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 178 aa  85.5  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1398  XRE family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.365461  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0521  cupin 2 domain-containing protein  31.77 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  31.41 
 
 		 188 aa  85.1  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0316  cupin 2 domain-containing protein  31.77 
 
 		 184 aa  84.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 192 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 192 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 192 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  31.02 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  30.27 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  27.07 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  27.62 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  30.59 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  30.65 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  29.57 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2171  transcriptional regulator  31.77 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.809699 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  30.9 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  28.11 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3684  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000437538  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  27.07 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  27.07 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  27.07 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  27.07 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  27.07 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  27.07 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5085  XRE family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00667568  normal  0.553791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3096  transcriptional regulator, XRE family  26.32 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00124629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0805  DNA-binding protein  25.97 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.602444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>