95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0284 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  59.28 
 
 		 583 aa  725    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  56.36 
 
 		 583 aa  711    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  73.2 
 
 		 584 aa  932    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  58.59 
 
 		 583 aa  718    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  58.68 
 
 		 597 aa  753    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  58.76 
 
 		 583 aa  723    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  100 
 
 		 584 aa  1222    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  46.13 
 
 		 566 aa  536  1e-151  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  46.48 
 
 		 567 aa  524  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  46.3 
 
 		 567 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  46.3 
 
 		 567 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  46.25 
 
 		 570 aa  513  1e-144  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  45.19 
 
 		 568 aa  514  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  46.13 
 
 		 567 aa  511  1e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  42.69 
 
 		 566 aa  498  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.22 
 
 		 569 aa  496  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  43.7 
 
 		 582 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  43.27 
 
 		 571 aa  491  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  42.17 
 
 		 578 aa  483  1e-135  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.32 
 
 		 570 aa  482  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  42.49 
 
 		 570 aa  482  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  41.17 
 
 		 568 aa  480  1e-134  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  41.27 
 
 		 566 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  40.66 
 
 		 565 aa  456  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.38 
 
 		 566 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.25 
 
 		 558 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37 
 
 		 552 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  36.57 
 
 		 555 aa  365  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.57 
 
 		 561 aa  354  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  34.62 
 
 		 566 aa  352  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.37 
 
 		 556 aa  351  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.77 
 
 		 561 aa  346  6e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.94 
 
 		 562 aa  345  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  34.48 
 
 		 561 aa  341  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.22 
 
 		 566 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  35.39 
 
 		 549 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  29.85 
 
 		 572 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  31.78 
 
 		 543 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  31.54 
 
 		 543 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  31.6 
 
 		 548 aa  261  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.59 
 
 		 542 aa  259  8e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.58 
 
 		 548 aa  256  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.24 
 
 		 548 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.06 
 
 		 548 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.98 
 
 		 432 aa  51.6  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  38.71 
 
 		 431 aa  51.2  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  41.43 
 
 		 436 aa  51.2  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2980  D-aminoacylase domain protein  39.71 
 
 		 528 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  45.33 
 
 		 461 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  41.27 
 
 		 385 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.48 
 
 		 426 aa  48.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4066  dihydropyrimidinase  37.21 
 
 		 479 aa  48.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  38.67 
 
 		 416 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39910  metal dependent hydrolase  38.46 
 
 		 520 aa  47.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  33.33 
 
 		 427 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  38.71 
 
 		 395 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  33.77 
 
 		 413 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  41.27 
 
 		 389 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  32 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0046  phenylhydantoinase  38.81 
 
 		 481 aa  46.6  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  37.1 
 
 		 426 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  27.36 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  35.37 
 
 		 497 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  41.94 
 
 		 388 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  34.34 
 
 		 417 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  44.19 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  40.62 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  43.75 
 
 		 377 aa  46.2  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  29.69 
 
 		 456 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  36.62 
 
 		 1005 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  38.1 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.1 
 
 		 429 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  34.34 
 
 		 423 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.07 
 
 		 434 aa  45.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  36.51 
 
 		 420 aa  45.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  31.3 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.1 
 
 		 429 aa  44.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  35.48 
 
 		 379 aa  44.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  26.35 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0331  dihydropyrimidinase  42.19 
 
 		 479 aa  44.7  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  38.03 
 
 		 413 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  31.08 
 
 		 425 aa  44.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  36.67 
 
 		 432 aa  44.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  39.68 
 
 		 483 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  41.27 
 
 		 428 aa  44.3  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1045  dihydroorotase  38.33 
 
 		 430 aa  44.3  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.197397  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  26.42 
 
 		 496 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.58 
 
 		 488 aa  44.3  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  42.62 
 
 		 422 aa  44.3  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  27.78 
 
 		 409 aa  44.3  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  40.62 
 
 		 425 aa  44.3  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.86 
 
 		 441 aa  43.9  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  37.88 
 
 		 485 aa  43.9  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  37.5 
 
 		 414 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3492  urease domain protein  34.18 
 
 		 256 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>