229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0024 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0087  preprotein translocase subunit SecY  78.86 
 
 		 492 aa  818    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.023527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0024  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 492 aa  969    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00318334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1705  preprotein translocase subunit SecY  63.07 
 
 		 537 aa  590  1e-167  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.602032  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0104  preprotein translocase subunit SecY  57.72 
 
 		 479 aa  566  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2230  preprotein translocase subunit SecY  55.92 
 
 		 479 aa  541  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.408121  normal  0.455137 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0555  preprotein translocase subunit SecY  56.59 
 
 		 477 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.323996 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0587  preprotein translocase subunit SecY  55.98 
 
 		 477 aa  532  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00173275  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0465  preprotein translocase subunit SecY  54.25 
 
 		 477 aa  529  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2426  preprotein translocase subunit SecY  54.29 
 
 		 492 aa  475  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2241  preprotein translocase, SecY subunit  51.08 
 
 		 500 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0233  preprotein translocase, SecY subunit  53.14 
 
 		 489 aa  457  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1851  preprotein translocase subunit SecY  51.55 
 
 		 504 aa  439  9.999999999999999e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.642367 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2315  preprotein translocase subunit SecY  50.88 
 
 		 491 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.368701  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1498  preprotein translocase, SecY subunit  43.74 
 
 		 599 aa  386  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.312314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0667  preprotein translocase subunit SecY  40.99 
 
 		 442 aa  323  6e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00940535 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1251  preprotein translocase subunit SecY  40.37 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.05624  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0156  preprotein translocase subunit SecY  40.08 
 
 		 442 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0733  preprotein translocase subunit SecY  40.53 
 
 		 443 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1407  preprotein translocase subunit SecY  38.04 
 
 		 443 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.886151  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0402  preprotein translocase subunit SecY  33.13 
 
 		 476 aa  234  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.144908 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_56443  transport protein Sec61 alpha subunit  30.91 
 
 		 559 aa  218  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0233  preprotein translocase subunit SecY  32.16 
 
 		 476 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.745222  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00040  protein transporter, putative  31.55 
 
 		 478 aa  217  5e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0114  preprotein translocase subunit SecY  28.69 
 
 		 463 aa  213  7e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.000000000441427  hitchhiker  0.00000810769 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27583  IISP family transporter: protein transport protein Sec61 alpha subunit  31.44 
 
 		 476 aa  209  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.527579  normal  0.285595 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07721  hypothetical protein similar to Sec61 (Broad)  30 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245702  normal  0.107035 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1755  Translocon Sec61/SecY, plug domain protein  29.5 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.227644  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68832  Protein transport protein SEC61 alpha subunit  28.54 
 
 		 478 aa  183  5.0000000000000004e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1254  preprotein translocase subunit SecY  27.36 
 
 		 482 aa  153  8e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000145561 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0964  preprotein translocase subunit SecY  26.71 
 
 		 460 aa  152  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.905411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1304  preprotein translocase subunit SecY  27.08 
 
 		 459 aa  150  7e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.783086 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1874  preprotein translocase subunit SecY  26.03 
 
 		 465 aa  146  9e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.653631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1034  preprotein translocase subunit SecY  27 
 
 		 455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000391627 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80530  protein involved in co-translational pathway of protein transport  24.8 
 
 		 501 aa  107  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5022  preprotein translocase subunit SecY  23.48 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  22.27 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1333  preprotein translocase subunit SecY  24.24 
 
 		 455 aa  67  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.158258 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  23.53 
 
 		 443 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  23.53 
 
 		 443 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  23.53 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  23.53 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  24.48 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  20.97 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0602  preprotein translocase subunit SecY  23.06 
 
 		 430 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.637505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1046  preprotein translocase subunit SecY  22.22 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303562  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1062  preprotein translocase subunit SecY  22.22 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal  0.323313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1074  preprotein translocase subunit SecY  22.22 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  23.83 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  23.83 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1347  preprotein translocase subunit SecY  24.27 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  24.53 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  23.65 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0053  preprotein translocase subunit SecY  26.01 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  23.68 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  21.86 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0735  preprotein translocase, SecY subunit  21.95 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  23.62 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_002936  DET0494  preprotein translocase subunit SecY  27.12 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.443171  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0446  preprotein translocase subunit SecY  21.68 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813945  hitchhiker  0.000170824 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  23.06 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  21.53 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  23.06 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  24.27 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  22.56 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  23.54 
 
 		 440 aa  58.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  22.15 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  24.3 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_436  preprotein translocase subunit SecY  26.78 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0195945  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04500  preprotein translocase subunit SecY  23.63 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.705639  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  22.02 
 
 		 444 aa  57  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  21.86 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  21.91 
 
 		 446 aa  56.6  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0504  preprotein translocase subunit SecY  21.49 
 
 		 443 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00015304  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  23.21 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  21.91 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  21.56 
 
 		 444 aa  56.6  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000317062  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1856  preprotein translocase subunit SecY  28.65 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  22.98 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0103  preprotein translocase subunit SecY  22.77 
 
 		 421 aa  55.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  26.92 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  23.72 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  22.98 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  22.22 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1685  preprotein translocase subunit SecY  26.19 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0245  preprotein translocase subunit SecY  28.1 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  21.83 
 
 		 436 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0509  preprotein translocase subunit SecY  21.41 
 
 		 443 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0470282  hitchhiker  0.00397274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  22.39 
 
 		 442 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20670  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  20.87 
 
 		 439 aa  55.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  22.25 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  21.56 
 
 		 444 aa  54.3  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  21.91 
 
 		 443 aa  54.7  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1374  preprotein translocase, SecY subunit  22.69 
 
 		 444 aa  54.7  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285774  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  22.4 
 
 		 440 aa  54.3  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2062  preprotein translocase subunit SecY  25.85 
 
 		 421 aa  54.3  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  21.91 
 
 		 446 aa  54.3  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  23.45 
 
 		 435 aa  53.5  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  22.11 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  22.9 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0496  preprotein translocase, SecY subunit  22.5 
 
 		 456 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.437531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>