More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0081 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0081  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  60.45 
 
 		 223 aa  263  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0302  DNA repair protein RadC  51.83 
 
 		 225 aa  225  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2739  DNA repair protein RadC  50.22 
 
 		 225 aa  219  3e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3048  DNA repair protein RadC  46.33 
 
 		 221 aa  208  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000891178  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2092  DNA repair protein RadC  45.62 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0110  hypothetical protein  48.83 
 
 		 247 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.222701  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0973  DNA repair protein RadC  41.44 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  42.34 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  40.89 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  40.27 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 225 aa  158  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  41.89 
 
 		 227 aa  157  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  39.38 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  39.11 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  39.82 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  41.15 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  41.07 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  36.65 
 
 		 223 aa  151  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  42.53 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  36.2 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  35.96 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  38.74 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  38.94 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  39.57 
 
 		 235 aa  147  8e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  40.71 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  35.56 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  40.93 
 
 		 233 aa  145  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  38.74 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  35.11 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  38.74 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  35.14 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  39.47 
 
 		 233 aa  141  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  33.48 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  36.68 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  37.83 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  37.12 
 
 		 231 aa  138  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  37.61 
 
 		 229 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  35.29 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  36.89 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  36.11 
 
 		 232 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1532  DNA repair protein RadC  38.05 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  39.46 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  37.28 
 
 		 229 aa  134  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  36.44 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1778  DNA repair protein RadC  35.84 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  40.58 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0215  DNA repair protein RadC  36.79 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  36.16 
 
 		 231 aa  131  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0172  DNA repair protein RadC  36.28 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  35.56 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  36.57 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2667  DNA repair protein RadC  35.84 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.581751 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0391  DNA repair protein RadC  32.74 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0400  DNA repair protein RadC  32.74 
 
 		 243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.161465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0983  DNA repair protein RadC  43.4 
 
 		 231 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  34.67 
 
 		 223 aa  128  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  41.33 
 
 		 229 aa  125  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  36.94 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  34.67 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  33.78 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2073  DNA repair protein RadC  33.78 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00545763 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  37.78 
 
 		 227 aa  124  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  36.32 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0176  DNA repair protein RadC  33.18 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.260187  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0630  DNA repair protein RadC  33.64 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  33.04 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  35.45 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  36.67 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  34.5 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  33.33 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  35.75 
 
 		 224 aa  121  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0523  DNA repair protein RadC  36.41 
 
 		 231 aa  121  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000215475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  36.56 
 
 		 223 aa  121  9e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  33.94 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0281  DNA repair protein RadC  35.81 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.257156  normal  0.0922067 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  36.44 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0186  DNA repair protein RadC  33.62 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.953222  hitchhiker  0.000000662884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0948  DNA repair protein RadC  37.39 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  0.486956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  35.09 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  35.34 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2777  DNA repair protein RadC  34.85 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3450  DNA repair protein RadC  34.85 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.268052  normal  0.632907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  34.98 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0067  DNA repair protein RadC  33.62 
 
 		 222 aa  118  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000216711  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1153  DNA repair protein  33.18 
 
 		 233 aa  118  7e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0917  DNA repair protein RadC  32.3 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.372898  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3339  DNA repair protein RadC  37.05 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0155907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4541  DNA repair protein  37.78 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  33.04 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  34.68 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  36.49 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>