More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2819 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  68.39 
 
 		 192 aa  271  4.0000000000000004e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  65.62 
 
 		 192 aa  268  4e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  63.54 
 
 		 192 aa  264  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  63.02 
 
 		 192 aa  260  8e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  64.06 
 
 		 192 aa  256  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  52.6 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 189 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 209 aa  178  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  47.4 
 
 		 192 aa  177  7e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  48.4 
 
 		 188 aa  177  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 188 aa  175  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  45.7 
 
 		 189 aa  175  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0402  transcriptional regulator, XRE family  46.07 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699228  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  44.27 
 
 		 191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  43.52 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  37.17 
 
 		 197 aa  130  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  39.89 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 196 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 198 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  36.04 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3393  transcriptional regulator, XRE family  32.46 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000124891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3456  transcriptional regulator, XRE family  32.46 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.07 
 
 		 503 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1110  Phosphate butyryltransferase  30.98 
 
 		 503 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  32.29 
 
 		 188 aa  100  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 178 aa  97.8  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  34.05 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 187 aa  95.1  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  32.6 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 193 aa  92.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  32.63 
 
 		 188 aa  92  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 187 aa  92  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 179 aa  92.4  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  31.49 
 
 		 191 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.95 
 
 		 189 aa  92  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  32.63 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 199 aa  91.3  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  32.79 
 
 		 182 aa  91.3  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  33.13 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 175 aa  88.6  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 		 211 aa  88.2  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0281  DNA-binding protein  30.94 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0958  DNA-binding protein  30.94 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704462  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1956  DNA-binding protein  30.94 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0867  DNA-binding protein  30.94 
 
 		 187 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  31.69 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  31.49 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  31.49 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  31.49 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  31.49 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  31.49 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  31.49 
 
 		 236 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  31.49 
 
 		 236 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  28.8 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  31.49 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  30.6 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1162  DNA-binding protein  29.51 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  29.79 
 
 		 218 aa  85.1  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 180 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 180 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 220 aa  85.1  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 180 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5086  putative transcriptional regulator, XRE family  30.48 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  30.39 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 432 aa  84.7  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1001  DNA-binding protein  30.39 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1806  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 181 aa  84.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2148  DNA-binding protein, putative  32.43 
 
 		 181 aa  84.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  33.51 
 
 		 199 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0495  transcriptional regulator, XRE family  29.84 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2171  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.809699 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>