More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2609 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2609  mRNA 3-end processing factor  100 
 
 		 397 aa  816    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0096  beta-lactamase-like  59.7 
 
 		 411 aa  501  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.619146  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3402  beta-lactamase domain protein  40.34 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  41.85 
 
 		 411 aa  315  9e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  41.65 
 
 		 414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.14 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  39.7 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0930  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.56 
 
 		 410 aa  256  6e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1989  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 		 422 aa  243  3e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.881158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0025  beta-lactamase domain-containing protein  37.53 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1361  beta-lactamase domain protein  36.61 
 
 		 422 aa  233  3e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1539  beta-lactamase domain-containing protein  35 
 
 		 421 aa  233  5e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000502709 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  35.57 
 
 		 428 aa  229  5e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1428  beta-lactamase domain-containing protein  36.48 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.1615  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1206  beta-lactamase domain-containing protein  35.78 
 
 		 433 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1416  beta-lactamase domain-containing protein  36.53 
 
 		 433 aa  224  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.449675  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1728  beta-lactamase domain-containing protein  36.17 
 
 		 425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.254192  decreased coverage  0.00045837 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1548  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 		 425 aa  219  5e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00297769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0480  beta-lactamase domain-containing protein  35.61 
 
 		 433 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104405  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1600  beta-lactamase domain-containing protein  33.91 
 
 		 421 aa  214  2.9999999999999995e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0760665 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1749  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 428 aa  206  9e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00852065 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0558  beta-lactamase domain-containing protein  34.65 
 
 		 430 aa  205  9e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00303127 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1047  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 		 426 aa  202  9e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0197  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.904798  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1292  beta-lactamase domain-containing protein  32.59 
 
 		 422 aa  199  9e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.358627  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0626  beta-lactamase domain-containing protein  32.59 
 
 		 422 aa  199  9e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1199  beta-lactamase domain-containing protein  33.03 
 
 		 630 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0390608  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1938  beta-lactamase domain protein  33 
 
 		 821 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.199019  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0691  beta-lactamase domain-containing protein  32.28 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0082  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 		 635 aa  186  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  32.45 
 
 		 635 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1572  beta-lactamase domain-containing protein  32.93 
 
 		 635 aa  183  6e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.342192  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1721  beta-lactamase domain-containing protein  32.93 
 
 		 635 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.959276 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0190  beta-lactamase domain-containing protein  32.93 
 
 		 635 aa  182  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0882  beta-lactamase domain-containing protein  32.69 
 
 		 635 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28665  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0777  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 630 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.867846  normal  0.0104567 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1014  ADP-ribosylation/crystallin J1  30.48 
 
 		 636 aa  179  9e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.5583 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1817  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  33.33 
 
 		 635 aa  178  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2254  beta-lactamase domain-containing protein  33.58 
 
 		 642 aa  177  3e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.311245 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0122  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  32.44 
 
 		 647 aa  177  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2698  beta-lactamase domain protein  30.82 
 
 		 641 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.132267  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1385  beta-lactamase domain-containing protein  30.02 
 
 		 639 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.741277  normal  0.763255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0193  cleavage and polyadenylation specificity factor  30.88 
 
 		 637 aa  172  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0060  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 		 634 aa  171  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.287706  normal  0.0538773 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1107  beta-lactamase domain-containing protein  33.79 
 
 		 640 aa  171  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.519523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2052  beta-lactamase domain protein  30.23 
 
 		 640 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0966  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 		 641 aa  171  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  32.95 
 
 		 639 aa  170  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0845  beta-lactamase-like  31.58 
 
 		 629 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.554835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2598  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  30.61 
 
 		 644 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0064  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 635 aa  166  5e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0325  KH-domain/beta-lactamase-domain protein  30.61 
 
 		 644 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.04093  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1727  beta-lactamase domain-containing protein  32.57 
 
 		 646 aa  162  8.000000000000001e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0637994 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0030  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 		 634 aa  161  2e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0375  beta-lactamase-like protein  31.37 
 
 		 636 aa  160  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000359908  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3129  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 		 634 aa  149  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.43915 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.91 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5264  beta-lactamase domain-containing protein  26.48 
 
 		 830 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1910  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 		 652 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000293974  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  28.18 
 
 		 462 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  27.68 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.68 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0455  beta-lactamase domain-containing protein  30.73 
 
 		 636 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.263173 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1883  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 		 456 aa  139  7e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.32 
 
 		 543 aa  139  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  29.41 
 
 		 452 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  27.74 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  28.37 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1456  beta-lactamase domain protein  25.74 
 
 		 464 aa  138  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.9 
 
 		 452 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  28.18 
 
 		 465 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33504  predicted protein  30.95 
 
 		 767 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.174633 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  25.34 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  29.12 
 
 		 465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.83 
 
 		 541 aa  133  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  26.98 
 
 		 452 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  27.58 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2131  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.43 
 
 		 466 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  27.02 
 
 		 468 aa  130  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2716  beta-lactamase domain protein  28.03 
 
 		 481 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.521064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  26.16 
 
 		 536 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 460 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2554  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 		 667 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000946841  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89936  predicted protein  27.63 
 
 		 793 aa  130  4.0000000000000003e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.731556  normal  0.295472 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  27.63 
 
 		 455 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  28.01 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  28.01 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  28.92 
 
 		 470 aa  127  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5141  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 		 577 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265268  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.42 
 
 		 471 aa  126  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  26.44 
 
 		 454 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  26.24 
 
 		 468 aa  126  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  26.94 
 
 		 536 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  25.81 
 
 		 536 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 461 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28482  predicted protein  29.8 
 
 		 602 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.962764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>