More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0078 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  100 
 
 		 162 aa  329  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  68.49 
 
 		 148 aa  209  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  55.33 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  53.95 
 
 		 150 aa  166  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  54.42 
 
 		 149 aa  164  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  51.35 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  54.42 
 
 		 153 aa  160  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  52.03 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  49.66 
 
 		 153 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  49.66 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  46.58 
 
 		 152 aa  147  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  49.66 
 
 		 149 aa  147  7e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  47.95 
 
 		 153 aa  146  9e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  48.63 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  48.98 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  48.63 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  47.95 
 
 		 153 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  48.63 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  49.3 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  48.57 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  45.95 
 
 		 176 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  46.48 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  45 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  43.45 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  44 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  44.53 
 
 		 155 aa  124  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  45.93 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  51.03 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  44.36 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  42.55 
 
 		 194 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  45.27 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  38.52 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  40.27 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  36.43 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  34.72 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  34.03 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  36.55 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  36.15 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  34.03 
 
 		 123 aa  63.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  34.88 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  36.81 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1550  ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0439  ribosomal protein S13  31.25 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0302  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420412  hitchhiker  0.0000142456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  36.11 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0859  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  34.11 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 122 aa  60.5  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  36.43 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  31.21 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  32.64 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  31.21 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0497  ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  35.86 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2302  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.408808  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  35.42 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2350  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09080  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.448669 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  31.21 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06470  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  31.78 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5150  30S ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.91661  normal  0.603958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  36.15 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0476  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 118 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000231121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5058  30S ribosomal protein S13  32.06 
 
 		 118 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000365808  normal  0.238672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 118 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  32.31 
 
 		 123 aa  57  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0505  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 118 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 124 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0836  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 119 aa  57  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0416  30S ribosomal protein S13  29.77 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0392  30S ribosomal protein S13  29.77 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  34.11 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  33.85 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0648  ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.945062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4527  30S ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0789  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0549018  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  30.23 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  33.33 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0741  30S ribosomal protein S13  30.53 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0141684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3887  30S ribosomal protein S13  31.3 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00983662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0204  30S ribosomal protein S13  34.03 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  32.56 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  34.62 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>