77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2662 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  100 
 
 
323 aa  654    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3606  PAAR repeat-containing protein  81.4 
 
 
96 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0646  hypothetical protein  32.36 
 
 
466 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0945  hypothetical protein  64.77 
 
 
176 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00120455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4258  PAAR repeat-containing protein  59.55 
 
 
169 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2083  hypothetical protein  35.26 
 
 
466 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2560  PAAR repeat-containing protein  58.44 
 
 
174 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.801514  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0034  hypothetical protein  68.42 
 
 
94 aa  96.3  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.543283  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0217  hypothetical protein  33.95 
 
 
465 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0368818  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5213  hypothetical protein  34.38 
 
 
482 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995542 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  51.89 
 
 
456 aa  84  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2373  hypothetical protein  61.54 
 
 
94 aa  83.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0243  hypothetical protein  30.38 
 
 
342 aa  82  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  53.66 
 
 
592 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  55.17 
 
 
461 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  28.21 
 
 
453 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3775  helix-turn-helix, AraC type  53.16 
 
 
540 aa  79  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  48.15 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0059  PAAR repeat-containing protein  51.9 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4885  hypothetical protein  34.88 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0979241  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  52.56 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4662  hypothetical protein  32.86 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.209439  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0769  hypothetical protein  32.82 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.627989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1157  PAAR repeat-containing protein  51.28 
 
 
100 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.811725  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2085  hypothetical protein  34.78 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0532  PAAR repeat-containing protein  53.66 
 
 
88 aa  67  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  51.22 
 
 
172 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0771  hypothetical protein  27.54 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5592  PAAR  48.24 
 
 
469 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3257  phospholipase  48.75 
 
 
101 aa  63.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2184  PAAR repeat-containing protein  54.55 
 
 
88 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.062242  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0079  hypothetical protein  26.48 
 
 
470 aa  59.3  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4551  PAAR repeat-containing protein  46.67 
 
 
185 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  45.05 
 
 
165 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3448  PAAR repeat-containing protein  53.45 
 
 
88 aa  56.6  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.86089  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  42.11 
 
 
1381 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  42.11 
 
 
1541 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  42.11 
 
 
1541 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  42.11 
 
 
1541 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  42.11 
 
 
1541 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1081  hypothetical protein  50 
 
 
102 aa  55.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.738335 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  42.11 
 
 
1541 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  42.11 
 
 
1541 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0093  hypothetical protein  38.52 
 
 
481 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3189  PAAR  44.09 
 
 
179 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563624  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5430  hypothetical protein  43.96 
 
 
174 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  43.06 
 
 
855 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  40.48 
 
 
1553 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  41.1 
 
 
88 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  41.54 
 
 
86 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  43.24 
 
 
1527 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  42.86 
 
 
1140 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  38.36 
 
 
1421 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3426  hypothetical protein  39.19 
 
 
386 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.967185  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  38.57 
 
 
1386 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  37.84 
 
 
1385 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4633  hypothetical protein  40.45 
 
 
177 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.53967  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  37.84 
 
 
1400 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  40.28 
 
 
1229 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  38.89 
 
 
1422 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  40 
 
 
1410 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  39.47 
 
 
1517 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  38.16 
 
 
1446 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  45.33 
 
 
96 aa  43.9  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  40.54 
 
 
406 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  37.84 
 
 
1409 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3817  PAAR  41.25 
 
 
181 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153298  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  36.84 
 
 
1494 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  36.84 
 
 
1494 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1832  hypothetical protein  38.27 
 
 
118 aa  43.5  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.643007 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  36.84 
 
 
1487 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  36.84 
 
 
1495 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0167  PAAR motif-containing protein  39.24 
 
 
434 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01140  hypothetical protein  39.24 
 
 
439 aa  42.7  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.337487  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  40.32 
 
 
102 aa  42.7  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3229  PAAR repeat-containing protein  41.18 
 
 
125 aa  42.7  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  40 
 
 
94 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>