15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0769 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0769  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.627989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4662  hypothetical protein  79.38 
 
 		 325 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.209439  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0771  hypothetical protein  63.44 
 
 		 324 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4885  hypothetical protein  52.65 
 
 		 323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0979241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0196  hypothetical protein  57.06 
 
 		 207 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5213  hypothetical protein  33.55 
 
 		 482 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00995542 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0646  hypothetical protein  34.03 
 
 		 466 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2083  hypothetical protein  31.74 
 
 		 466 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0243  hypothetical protein  29.32 
 
 		 342 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0079  hypothetical protein  29.66 
 
 		 470 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0217  hypothetical protein  29.48 
 
 		 465 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0368818  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2659  hypothetical protein  34.23 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2085  hypothetical protein  30.86 
 
 		 243 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  25.25 
 
 		 453 aa  72.8  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>