15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4885 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4885  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0979241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0771  hypothetical protein  55.31 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4662  hypothetical protein  51.7 
 
 		 325 aa  311  9e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.209439  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0769  hypothetical protein  53.56 
 
 		 325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.627989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0196  hypothetical protein  55.33 
 
 		 207 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5213  hypothetical protein  30.7 
 
 		 482 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00995542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2083  hypothetical protein  29.76 
 
 		 466 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0079  hypothetical protein  32.53 
 
 		 470 aa  99  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0243  hypothetical protein  27.57 
 
 		 342 aa  95.9  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0646  hypothetical protein  30.82 
 
 		 466 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2085  hypothetical protein  29.07 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2662  PAAR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0217  hypothetical protein  24.39 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0368818  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2659  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0887965  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  26.25 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>